Protein–RNA interactions for Protein: O00273

DFFA, DNA fragmentation factor subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DFFAO00273 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
DFFAO00273 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
DFFAO00273 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
DFFAO00273 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
DFFAO00273 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
DFFAO00273 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
DFFAO00273 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
DFFAO00273 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
DFFAO00273 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
DFFAO00273 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
DFFAO00273 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
DFFAO00273 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
DFFAO00273 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
DFFAO00273 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
DFFAO00273 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
DFFAO00273 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
DFFAO00273 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
DFFAO00273 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
DFFAO00273 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
DFFAO00273 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
DFFAO00273 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
DFFAO00273 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
DFFAO00273 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
DFFAO00273 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
DFFAO00273 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
DFFAO00273 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
DFFAO00273 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
DFFAO00273 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
DFFAO00273 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
DFFAO00273 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
DFFAO00273 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
DFFAO00273 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
DFFAO00273 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
DFFAO00273 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
DFFAO00273 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
DFFAO00273 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
DFFAO00273 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
DFFAO00273 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
DFFAO00273 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
DFFAO00273 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC18.94■□□□□ 0.62
DFFAO00273 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
DFFAO00273 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
DFFAO00273 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
DFFAO00273 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
DFFAO00273 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
DFFAO00273 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
DFFAO00273 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
DFFAO00273 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
DFFAO00273 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
DFFAO00273 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
DFFAO00273 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
DFFAO00273 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
DFFAO00273 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
DFFAO00273 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC18.93■□□□□ 0.62
DFFAO00273 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
DFFAO00273 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
DFFAO00273 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
DFFAO00273 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
DFFAO00273 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
DFFAO00273 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
DFFAO00273 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
DFFAO00273 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
DFFAO00273 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
DFFAO00273 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
DFFAO00273 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
DFFAO00273 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
DFFAO00273 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
DFFAO00273 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
DFFAO00273 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
DFFAO00273 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
DFFAO00273 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
DFFAO00273 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
DFFAO00273 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
DFFAO00273 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
DFFAO00273 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
DFFAO00273 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
DFFAO00273 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
DFFAO00273 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
DFFAO00273 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
DFFAO00273 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
DFFAO00273 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
DFFAO00273 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
DFFAO00273 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
DFFAO00273 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
DFFAO00273 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
DFFAO00273 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
DFFAO00273 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
DFFAO00273 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
DFFAO00273 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
DFFAO00273 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
DFFAO00273 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
DFFAO00273 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
DFFAO00273 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
DFFAO00273 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
DFFAO00273 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
DFFAO00273 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
DFFAO00273 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.92■□□□□ 0.62
DFFAO00273 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
DFFAO00273 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
DFFAO00273 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms