Protein–RNA interactions for Protein: C9JSJ3

BHMG1, Basic helix-loop-helix and HMG box domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHMG1C9JSJ3 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
BHMG1C9JSJ3 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
BHMG1C9JSJ3 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
BHMG1C9JSJ3 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
BHMG1C9JSJ3 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
BHMG1C9JSJ3 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
BHMG1C9JSJ3 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
BHMG1C9JSJ3 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
BHMG1C9JSJ3 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
BHMG1C9JSJ3 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
BHMG1C9JSJ3 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
BHMG1C9JSJ3 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
BHMG1C9JSJ3 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
BHMG1C9JSJ3 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
BHMG1C9JSJ3 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
BHMG1C9JSJ3 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
BHMG1C9JSJ3 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
BHMG1C9JSJ3 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
BHMG1C9JSJ3 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
BHMG1C9JSJ3 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
BHMG1C9JSJ3 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
BHMG1C9JSJ3 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
BHMG1C9JSJ3 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
BHMG1C9JSJ3 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
BHMG1C9JSJ3 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
BHMG1C9JSJ3 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
BHMG1C9JSJ3 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
BHMG1C9JSJ3 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
BHMG1C9JSJ3 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
BHMG1C9JSJ3 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
BHMG1C9JSJ3 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
BHMG1C9JSJ3 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
BHMG1C9JSJ3 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
BHMG1C9JSJ3 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC18.98■□□□□ 0.63
BHMG1C9JSJ3 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
BHMG1C9JSJ3 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
BHMG1C9JSJ3 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
BHMG1C9JSJ3 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
BHMG1C9JSJ3 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
BHMG1C9JSJ3 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
BHMG1C9JSJ3 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
BHMG1C9JSJ3 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
BHMG1C9JSJ3 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
BHMG1C9JSJ3 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
BHMG1C9JSJ3 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
BHMG1C9JSJ3 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
BHMG1C9JSJ3 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
BHMG1C9JSJ3 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
BHMG1C9JSJ3 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
BHMG1C9JSJ3 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
BHMG1C9JSJ3 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
BHMG1C9JSJ3 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
BHMG1C9JSJ3 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
BHMG1C9JSJ3 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
BHMG1C9JSJ3 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
BHMG1C9JSJ3 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
BHMG1C9JSJ3 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
BHMG1C9JSJ3 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
BHMG1C9JSJ3 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
BHMG1C9JSJ3 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
BHMG1C9JSJ3 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
BHMG1C9JSJ3 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
BHMG1C9JSJ3 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
BHMG1C9JSJ3 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
BHMG1C9JSJ3 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
BHMG1C9JSJ3 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
BHMG1C9JSJ3 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
BHMG1C9JSJ3 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
BHMG1C9JSJ3 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
BHMG1C9JSJ3 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
BHMG1C9JSJ3 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
BHMG1C9JSJ3 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
BHMG1C9JSJ3 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
BHMG1C9JSJ3 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
BHMG1C9JSJ3 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
BHMG1C9JSJ3 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
BHMG1C9JSJ3 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
BHMG1C9JSJ3 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
BHMG1C9JSJ3 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
BHMG1C9JSJ3 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
BHMG1C9JSJ3 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
BHMG1C9JSJ3 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
BHMG1C9JSJ3 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
BHMG1C9JSJ3 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
BHMG1C9JSJ3 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
BHMG1C9JSJ3 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
BHMG1C9JSJ3 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
BHMG1C9JSJ3 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
BHMG1C9JSJ3 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
BHMG1C9JSJ3 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
BHMG1C9JSJ3 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
BHMG1C9JSJ3 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
BHMG1C9JSJ3 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
BHMG1C9JSJ3 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
BHMG1C9JSJ3 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
BHMG1C9JSJ3 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
BHMG1C9JSJ3 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
BHMG1C9JSJ3 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
BHMG1C9JSJ3 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
BHMG1C9JSJ3 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms