Protein–RNA interactions for Protein: B4DSR2

cDNA FLJ52234, humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4DSR2 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
B4DSR2 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
B4DSR2 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC15.06■□□□□ 0
B4DSR2 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC15.06■□□□□ 0
B4DSR2 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
B4DSR2 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
B4DSR2 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
B4DSR2 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
B4DSR2 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
B4DSR2 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
B4DSR2 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
B4DSR2 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
B4DSR2 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
B4DSR2 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
B4DSR2 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
B4DSR2 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
B4DSR2 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
B4DSR2 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
B4DSR2 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
B4DSR2 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
B4DSR2 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
B4DSR2 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
B4DSR2 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
B4DSR2 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
B4DSR2 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
B4DSR2 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
B4DSR2 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
B4DSR2 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
B4DSR2 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
B4DSR2 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
B4DSR2 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
B4DSR2 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
B4DSR2 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
B4DSR2 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
B4DSR2 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
B4DSR2 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
B4DSR2 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
B4DSR2 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
B4DSR2 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
B4DSR2 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
B4DSR2 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
B4DSR2 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
B4DSR2 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
B4DSR2 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
B4DSR2 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
B4DSR2 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
B4DSR2 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
B4DSR2 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
B4DSR2 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
B4DSR2 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
B4DSR2 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
B4DSR2 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
B4DSR2 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
B4DSR2 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC15.04■□□□□ -0
B4DSR2 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
B4DSR2 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
B4DSR2 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
B4DSR2 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC15.04■□□□□ -0
B4DSR2 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
B4DSR2 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
B4DSR2 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC15.04■□□□□ -0
B4DSR2 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
B4DSR2 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
B4DSR2 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
B4DSR2 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC15.04■□□□□ -0
B4DSR2 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
B4DSR2 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
B4DSR2 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
B4DSR2 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
B4DSR2 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
B4DSR2 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
B4DSR2 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
B4DSR2 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
B4DSR2 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
B4DSR2 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
B4DSR2 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
B4DSR2 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
B4DSR2 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
B4DSR2 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
B4DSR2 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
B4DSR2 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
B4DSR2 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
B4DSR2 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
B4DSR2 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
B4DSR2 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
B4DSR2 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
B4DSR2 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
B4DSR2 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC15.03■□□□□ -0
B4DSR2 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
B4DSR2 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
B4DSR2 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
B4DSR2 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
B4DSR2 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
B4DSR2 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
B4DSR2 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
B4DSR2 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
B4DSR2 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
B4DSR2 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
B4DSR2 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
B4DSR2 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms