Protein–RNA interactions for Protein: A5PKW4

PSD, PH and SEC7 domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSDA5PKW4 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PSDA5PKW4 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PSDA5PKW4 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PSDA5PKW4 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
PSDA5PKW4 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PSDA5PKW4 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PSDA5PKW4 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PSDA5PKW4 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PSDA5PKW4 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PSDA5PKW4 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PSDA5PKW4 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PSDA5PKW4 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
PSDA5PKW4 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PSDA5PKW4 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PSDA5PKW4 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PSDA5PKW4 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PSDA5PKW4 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PSDA5PKW4 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PSDA5PKW4 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PSDA5PKW4 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PSDA5PKW4 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PSDA5PKW4 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PSDA5PKW4 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PSDA5PKW4 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PSDA5PKW4 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PSDA5PKW4 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PSDA5PKW4 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PSDA5PKW4 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PSDA5PKW4 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PSDA5PKW4 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PSDA5PKW4 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PSDA5PKW4 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PSDA5PKW4 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PSDA5PKW4 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PSDA5PKW4 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PSDA5PKW4 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PSDA5PKW4 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PSDA5PKW4 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PSDA5PKW4 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PSDA5PKW4 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PSDA5PKW4 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
PSDA5PKW4 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
PSDA5PKW4 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
PSDA5PKW4 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PSDA5PKW4 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PSDA5PKW4 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PSDA5PKW4 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PSDA5PKW4 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PSDA5PKW4 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PSDA5PKW4 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PSDA5PKW4 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PSDA5PKW4 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PSDA5PKW4 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PSDA5PKW4 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PSDA5PKW4 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PSDA5PKW4 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PSDA5PKW4 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PSDA5PKW4 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PSDA5PKW4 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PSDA5PKW4 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PSDA5PKW4 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PSDA5PKW4 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
PSDA5PKW4 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PSDA5PKW4 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PSDA5PKW4 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PSDA5PKW4 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PSDA5PKW4 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PSDA5PKW4 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
PSDA5PKW4 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PSDA5PKW4 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
PSDA5PKW4 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PSDA5PKW4 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PSDA5PKW4 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PSDA5PKW4 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
PSDA5PKW4 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PSDA5PKW4 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PSDA5PKW4 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PSDA5PKW4 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PSDA5PKW4 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PSDA5PKW4 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PSDA5PKW4 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PSDA5PKW4 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PSDA5PKW4 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PSDA5PKW4 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PSDA5PKW4 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PSDA5PKW4 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PSDA5PKW4 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
PSDA5PKW4 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PSDA5PKW4 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PSDA5PKW4 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
PSDA5PKW4 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PSDA5PKW4 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PSDA5PKW4 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PSDA5PKW4 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PSDA5PKW4 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PSDA5PKW4 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PSDA5PKW4 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PSDA5PKW4 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PSDA5PKW4 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
PSDA5PKW4 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms