Protein–RNA interactions for Protein: A3QJZ6

PRAMEF22, PRAME family member 22, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF22A3QJZ6 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRAMEF22A3QJZ6 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRAMEF22A3QJZ6 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRAMEF22A3QJZ6 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRAMEF22A3QJZ6 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRAMEF22A3QJZ6 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRAMEF22A3QJZ6 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRAMEF22A3QJZ6 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRAMEF22A3QJZ6 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRAMEF22A3QJZ6 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRAMEF22A3QJZ6 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRAMEF22A3QJZ6 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRAMEF22A3QJZ6 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRAMEF22A3QJZ6 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRAMEF22A3QJZ6 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRAMEF22A3QJZ6 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRAMEF22A3QJZ6 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRAMEF22A3QJZ6 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRAMEF22A3QJZ6 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRAMEF22A3QJZ6 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRAMEF22A3QJZ6 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRAMEF22A3QJZ6 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRAMEF22A3QJZ6 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
PRAMEF22A3QJZ6 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRAMEF22A3QJZ6 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRAMEF22A3QJZ6 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRAMEF22A3QJZ6 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRAMEF22A3QJZ6 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
PRAMEF22A3QJZ6 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRAMEF22A3QJZ6 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRAMEF22A3QJZ6 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRAMEF22A3QJZ6 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRAMEF22A3QJZ6 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRAMEF22A3QJZ6 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRAMEF22A3QJZ6 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRAMEF22A3QJZ6 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRAMEF22A3QJZ6 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRAMEF22A3QJZ6 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRAMEF22A3QJZ6 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRAMEF22A3QJZ6 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRAMEF22A3QJZ6 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRAMEF22A3QJZ6 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRAMEF22A3QJZ6 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRAMEF22A3QJZ6 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRAMEF22A3QJZ6 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRAMEF22A3QJZ6 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRAMEF22A3QJZ6 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRAMEF22A3QJZ6 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRAMEF22A3QJZ6 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
PRAMEF22A3QJZ6 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
PRAMEF22A3QJZ6 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRAMEF22A3QJZ6 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRAMEF22A3QJZ6 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRAMEF22A3QJZ6 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRAMEF22A3QJZ6 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRAMEF22A3QJZ6 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRAMEF22A3QJZ6 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRAMEF22A3QJZ6 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRAMEF22A3QJZ6 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRAMEF22A3QJZ6 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRAMEF22A3QJZ6 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRAMEF22A3QJZ6 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRAMEF22A3QJZ6 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRAMEF22A3QJZ6 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRAMEF22A3QJZ6 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRAMEF22A3QJZ6 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRAMEF22A3QJZ6 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRAMEF22A3QJZ6 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRAMEF22A3QJZ6 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRAMEF22A3QJZ6 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRAMEF22A3QJZ6 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
PRAMEF22A3QJZ6 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRAMEF22A3QJZ6 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRAMEF22A3QJZ6 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRAMEF22A3QJZ6 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRAMEF22A3QJZ6 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRAMEF22A3QJZ6 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRAMEF22A3QJZ6 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
PRAMEF22A3QJZ6 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRAMEF22A3QJZ6 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRAMEF22A3QJZ6 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRAMEF22A3QJZ6 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PRAMEF22A3QJZ6 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PRAMEF22A3QJZ6 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PRAMEF22A3QJZ6 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PRAMEF22A3QJZ6 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PRAMEF22A3QJZ6 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PRAMEF22A3QJZ6 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PRAMEF22A3QJZ6 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PRAMEF22A3QJZ6 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PRAMEF22A3QJZ6 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PRAMEF22A3QJZ6 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PRAMEF22A3QJZ6 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PRAMEF22A3QJZ6 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
PRAMEF22A3QJZ6 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
PRAMEF22A3QJZ6 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PRAMEF22A3QJZ6 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PRAMEF22A3QJZ6 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PRAMEF22A3QJZ6 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
PRAMEF22A3QJZ6 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms