Protein–RNA interactions for Protein: A2RU54

HMX2, Homeobox protein HMX2, humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMX2A2RU54 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HMX2A2RU54 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HMX2A2RU54 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HMX2A2RU54 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HMX2A2RU54 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HMX2A2RU54 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HMX2A2RU54 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HMX2A2RU54 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HMX2A2RU54 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HMX2A2RU54 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
HMX2A2RU54 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HMX2A2RU54 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HMX2A2RU54 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HMX2A2RU54 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HMX2A2RU54 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HMX2A2RU54 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HMX2A2RU54 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HMX2A2RU54 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HMX2A2RU54 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HMX2A2RU54 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HMX2A2RU54 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
HMX2A2RU54 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
HMX2A2RU54 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HMX2A2RU54 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HMX2A2RU54 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HMX2A2RU54 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HMX2A2RU54 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HMX2A2RU54 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
HMX2A2RU54 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
HMX2A2RU54 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HMX2A2RU54 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HMX2A2RU54 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HMX2A2RU54 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HMX2A2RU54 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HMX2A2RU54 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HMX2A2RU54 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HMX2A2RU54 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HMX2A2RU54 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HMX2A2RU54 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HMX2A2RU54 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HMX2A2RU54 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
HMX2A2RU54 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HMX2A2RU54 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HMX2A2RU54 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HMX2A2RU54 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HMX2A2RU54 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
HMX2A2RU54 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HMX2A2RU54 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HMX2A2RU54 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HMX2A2RU54 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HMX2A2RU54 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HMX2A2RU54 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HMX2A2RU54 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
HMX2A2RU54 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
HMX2A2RU54 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HMX2A2RU54 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HMX2A2RU54 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HMX2A2RU54 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HMX2A2RU54 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HMX2A2RU54 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
HMX2A2RU54 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HMX2A2RU54 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HMX2A2RU54 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HMX2A2RU54 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HMX2A2RU54 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HMX2A2RU54 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HMX2A2RU54 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HMX2A2RU54 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HMX2A2RU54 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HMX2A2RU54 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HMX2A2RU54 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HMX2A2RU54 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HMX2A2RU54 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HMX2A2RU54 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HMX2A2RU54 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HMX2A2RU54 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HMX2A2RU54 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HMX2A2RU54 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HMX2A2RU54 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HMX2A2RU54 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
HMX2A2RU54 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HMX2A2RU54 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HMX2A2RU54 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
HMX2A2RU54 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HMX2A2RU54 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HMX2A2RU54 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HMX2A2RU54 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HMX2A2RU54 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HMX2A2RU54 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HMX2A2RU54 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HMX2A2RU54 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HMX2A2RU54 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HMX2A2RU54 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HMX2A2RU54 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HMX2A2RU54 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HMX2A2RU54 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HMX2A2RU54 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HMX2A2RU54 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HMX2A2RU54 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HMX2A2RU54 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.9 ms