Protein–RNA interactions for Protein: A1A4Y4

IRGM, Immunity-related GTPase family M protein, humanhuman

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRGMA1A4Y4 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
IRGMA1A4Y4 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
IRGMA1A4Y4 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
IRGMA1A4Y4 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
IRGMA1A4Y4 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
IRGMA1A4Y4 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
IRGMA1A4Y4 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
IRGMA1A4Y4 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
IRGMA1A4Y4 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
IRGMA1A4Y4 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
IRGMA1A4Y4 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
IRGMA1A4Y4 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
IRGMA1A4Y4 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
IRGMA1A4Y4 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
IRGMA1A4Y4 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
IRGMA1A4Y4 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
IRGMA1A4Y4 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
IRGMA1A4Y4 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
IRGMA1A4Y4 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
IRGMA1A4Y4 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
IRGMA1A4Y4 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
IRGMA1A4Y4 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
IRGMA1A4Y4 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
IRGMA1A4Y4 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
IRGMA1A4Y4 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
IRGMA1A4Y4 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
IRGMA1A4Y4 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
IRGMA1A4Y4 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
IRGMA1A4Y4 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
IRGMA1A4Y4 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
IRGMA1A4Y4 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
IRGMA1A4Y4 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
IRGMA1A4Y4 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
IRGMA1A4Y4 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
IRGMA1A4Y4 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
IRGMA1A4Y4 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
IRGMA1A4Y4 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
IRGMA1A4Y4 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
IRGMA1A4Y4 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
IRGMA1A4Y4 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
IRGMA1A4Y4 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
IRGMA1A4Y4 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
IRGMA1A4Y4 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
IRGMA1A4Y4 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
IRGMA1A4Y4 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
IRGMA1A4Y4 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
IRGMA1A4Y4 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
IRGMA1A4Y4 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
IRGMA1A4Y4 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
IRGMA1A4Y4 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
IRGMA1A4Y4 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
IRGMA1A4Y4 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
IRGMA1A4Y4 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
IRGMA1A4Y4 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
IRGMA1A4Y4 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
IRGMA1A4Y4 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
IRGMA1A4Y4 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
IRGMA1A4Y4 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
IRGMA1A4Y4 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
IRGMA1A4Y4 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
IRGMA1A4Y4 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
IRGMA1A4Y4 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
IRGMA1A4Y4 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
IRGMA1A4Y4 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
IRGMA1A4Y4 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
IRGMA1A4Y4 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
IRGMA1A4Y4 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
IRGMA1A4Y4 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
IRGMA1A4Y4 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
IRGMA1A4Y4 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
IRGMA1A4Y4 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
IRGMA1A4Y4 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
IRGMA1A4Y4 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
IRGMA1A4Y4 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
IRGMA1A4Y4 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
IRGMA1A4Y4 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
IRGMA1A4Y4 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
IRGMA1A4Y4 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
IRGMA1A4Y4 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
IRGMA1A4Y4 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
IRGMA1A4Y4 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
IRGMA1A4Y4 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
IRGMA1A4Y4 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
IRGMA1A4Y4 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
IRGMA1A4Y4 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
IRGMA1A4Y4 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
IRGMA1A4Y4 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
IRGMA1A4Y4 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
IRGMA1A4Y4 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
IRGMA1A4Y4 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
IRGMA1A4Y4 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
IRGMA1A4Y4 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
IRGMA1A4Y4 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
IRGMA1A4Y4 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
IRGMA1A4Y4 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
IRGMA1A4Y4 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
IRGMA1A4Y4 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
IRGMA1A4Y4 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
IRGMA1A4Y4 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
IRGMA1A4Y4 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms