Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1P4

Lgr5, Leucine-rich repeat-containing G-protein coupled receptor 5, mousemouse

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lgr5Q9Z1P4 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Lgr5Q9Z1P4 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Lgr5Q9Z1P4 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Lgr5Q9Z1P4 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Lgr5Q9Z1P4 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Lgr5Q9Z1P4 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Lgr5Q9Z1P4 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Lgr5Q9Z1P4 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Lgr5Q9Z1P4 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Lgr5Q9Z1P4 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Lgr5Q9Z1P4 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Lgr5Q9Z1P4 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Lgr5Q9Z1P4 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
Lgr5Q9Z1P4 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Lgr5Q9Z1P4 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Lgr5Q9Z1P4 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Lgr5Q9Z1P4 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Lgr5Q9Z1P4 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Lgr5Q9Z1P4 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
Lgr5Q9Z1P4 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Lgr5Q9Z1P4 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Lgr5Q9Z1P4 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Lgr5Q9Z1P4 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
Lgr5Q9Z1P4 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Lgr5Q9Z1P4 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Lgr5Q9Z1P4 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Lgr5Q9Z1P4 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Lgr5Q9Z1P4 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Lgr5Q9Z1P4 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Lgr5Q9Z1P4 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Lgr5Q9Z1P4 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Lgr5Q9Z1P4 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
Lgr5Q9Z1P4 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Lgr5Q9Z1P4 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Lgr5Q9Z1P4 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Lgr5Q9Z1P4 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Lgr5Q9Z1P4 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Lgr5Q9Z1P4 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Lgr5Q9Z1P4 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Lgr5Q9Z1P4 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Lgr5Q9Z1P4 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Lgr5Q9Z1P4 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Lgr5Q9Z1P4 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Lgr5Q9Z1P4 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Lgr5Q9Z1P4 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Lgr5Q9Z1P4 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Lgr5Q9Z1P4 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Lgr5Q9Z1P4 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Lgr5Q9Z1P4 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Lgr5Q9Z1P4 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Lgr5Q9Z1P4 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Lgr5Q9Z1P4 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Lgr5Q9Z1P4 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Lgr5Q9Z1P4 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Lgr5Q9Z1P4 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Lgr5Q9Z1P4 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Lgr5Q9Z1P4 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Lgr5Q9Z1P4 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Lgr5Q9Z1P4 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Lgr5Q9Z1P4 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Lgr5Q9Z1P4 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Lgr5Q9Z1P4 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Lgr5Q9Z1P4 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Lgr5Q9Z1P4 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Lgr5Q9Z1P4 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Lgr5Q9Z1P4 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Lgr5Q9Z1P4 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Lgr5Q9Z1P4 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Lgr5Q9Z1P4 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Lgr5Q9Z1P4 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Lgr5Q9Z1P4 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Lgr5Q9Z1P4 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
Lgr5Q9Z1P4 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Lgr5Q9Z1P4 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Lgr5Q9Z1P4 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Lgr5Q9Z1P4 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Lgr5Q9Z1P4 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
Lgr5Q9Z1P4 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Lgr5Q9Z1P4 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Lgr5Q9Z1P4 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Lgr5Q9Z1P4 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Lgr5Q9Z1P4 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Lgr5Q9Z1P4 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Lgr5Q9Z1P4 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Lgr5Q9Z1P4 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Lgr5Q9Z1P4 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Lgr5Q9Z1P4 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Lgr5Q9Z1P4 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Lgr5Q9Z1P4 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Lgr5Q9Z1P4 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Lgr5Q9Z1P4 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Lgr5Q9Z1P4 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Lgr5Q9Z1P4 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
Lgr5Q9Z1P4 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Lgr5Q9Z1P4 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Lgr5Q9Z1P4 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Lgr5Q9Z1P4 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Lgr5Q9Z1P4 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Lgr5Q9Z1P4 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Lgr5Q9Z1P4 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 146.4 ms