Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y324

FCF1, rRNA-processing protein FCF1 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FCF1Q9Y324 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
FCF1Q9Y324 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
FCF1Q9Y324 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
FCF1Q9Y324 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
FCF1Q9Y324 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
FCF1Q9Y324 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
FCF1Q9Y324 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
FCF1Q9Y324 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
FCF1Q9Y324 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
FCF1Q9Y324 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
FCF1Q9Y324 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
FCF1Q9Y324 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
FCF1Q9Y324 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
FCF1Q9Y324 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
FCF1Q9Y324 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
FCF1Q9Y324 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
FCF1Q9Y324 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
FCF1Q9Y324 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
FCF1Q9Y324 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
FCF1Q9Y324 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
FCF1Q9Y324 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
FCF1Q9Y324 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
FCF1Q9Y324 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
FCF1Q9Y324 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
FCF1Q9Y324 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
FCF1Q9Y324 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
FCF1Q9Y324 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
FCF1Q9Y324 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
FCF1Q9Y324 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
FCF1Q9Y324 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
FCF1Q9Y324 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
FCF1Q9Y324 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
FCF1Q9Y324 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
FCF1Q9Y324 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
FCF1Q9Y324 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
FCF1Q9Y324 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
FCF1Q9Y324 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
FCF1Q9Y324 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
FCF1Q9Y324 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
FCF1Q9Y324 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
FCF1Q9Y324 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
FCF1Q9Y324 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
FCF1Q9Y324 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
FCF1Q9Y324 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
FCF1Q9Y324 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
FCF1Q9Y324 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
FCF1Q9Y324 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
FCF1Q9Y324 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
FCF1Q9Y324 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
FCF1Q9Y324 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
FCF1Q9Y324 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
FCF1Q9Y324 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
FCF1Q9Y324 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
FCF1Q9Y324 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
FCF1Q9Y324 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
FCF1Q9Y324 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
FCF1Q9Y324 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
FCF1Q9Y324 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
FCF1Q9Y324 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
FCF1Q9Y324 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
FCF1Q9Y324 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
FCF1Q9Y324 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
FCF1Q9Y324 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
FCF1Q9Y324 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
FCF1Q9Y324 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
FCF1Q9Y324 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
FCF1Q9Y324 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
FCF1Q9Y324 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
FCF1Q9Y324 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
FCF1Q9Y324 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
FCF1Q9Y324 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
FCF1Q9Y324 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
FCF1Q9Y324 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
FCF1Q9Y324 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
FCF1Q9Y324 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
FCF1Q9Y324 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
FCF1Q9Y324 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
FCF1Q9Y324 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
FCF1Q9Y324 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
FCF1Q9Y324 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
FCF1Q9Y324 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
FCF1Q9Y324 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
FCF1Q9Y324 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
FCF1Q9Y324 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
FCF1Q9Y324 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
FCF1Q9Y324 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
FCF1Q9Y324 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
FCF1Q9Y324 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
FCF1Q9Y324 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
FCF1Q9Y324 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
FCF1Q9Y324 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
FCF1Q9Y324 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
FCF1Q9Y324 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
FCF1Q9Y324 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
FCF1Q9Y324 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
FCF1Q9Y324 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
FCF1Q9Y324 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
FCF1Q9Y324 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
FCF1Q9Y324 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
FCF1Q9Y324 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms