Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUS4

Gja10, Gap junction alpha-10 protein, mousemouse

Predictions only

Length 505 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja10Q9WUS4 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Gja10Q9WUS4 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Gja10Q9WUS4 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
Gja10Q9WUS4 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Gja10Q9WUS4 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Gja10Q9WUS4 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
Gja10Q9WUS4 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Gja10Q9WUS4 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Gja10Q9WUS4 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Gja10Q9WUS4 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Gja10Q9WUS4 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
Gja10Q9WUS4 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Gja10Q9WUS4 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Gja10Q9WUS4 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Gja10Q9WUS4 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Gja10Q9WUS4 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Gja10Q9WUS4 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Gja10Q9WUS4 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Gja10Q9WUS4 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Gja10Q9WUS4 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Gja10Q9WUS4 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Gja10Q9WUS4 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Gja10Q9WUS4 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Gja10Q9WUS4 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Gja10Q9WUS4 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Gja10Q9WUS4 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
Gja10Q9WUS4 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Gja10Q9WUS4 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Gja10Q9WUS4 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Gja10Q9WUS4 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Gja10Q9WUS4 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Gja10Q9WUS4 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Gja10Q9WUS4 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Gja10Q9WUS4 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Gja10Q9WUS4 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Gja10Q9WUS4 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Gja10Q9WUS4 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Gja10Q9WUS4 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Gja10Q9WUS4 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Gja10Q9WUS4 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Gja10Q9WUS4 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Gja10Q9WUS4 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Gja10Q9WUS4 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Gja10Q9WUS4 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Gja10Q9WUS4 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Gja10Q9WUS4 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Gja10Q9WUS4 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Gja10Q9WUS4 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Gja10Q9WUS4 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Gja10Q9WUS4 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Gja10Q9WUS4 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Gja10Q9WUS4 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Gja10Q9WUS4 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.07
Gja10Q9WUS4 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Gja10Q9WUS4 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Gja10Q9WUS4 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Gja10Q9WUS4 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Gja10Q9WUS4 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Gja10Q9WUS4 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Gja10Q9WUS4 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Gja10Q9WUS4 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Gja10Q9WUS4 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Gja10Q9WUS4 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Gja10Q9WUS4 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Gja10Q9WUS4 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Gja10Q9WUS4 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Gja10Q9WUS4 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
Gja10Q9WUS4 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Gja10Q9WUS4 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Gja10Q9WUS4 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Gja10Q9WUS4 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
Gja10Q9WUS4 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Gja10Q9WUS4 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Gja10Q9WUS4 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
Gja10Q9WUS4 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Gja10Q9WUS4 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Gja10Q9WUS4 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Gja10Q9WUS4 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Gja10Q9WUS4 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Gja10Q9WUS4 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Gja10Q9WUS4 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Gja10Q9WUS4 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
Gja10Q9WUS4 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
Gja10Q9WUS4 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
Gja10Q9WUS4 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Gja10Q9WUS4 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Gja10Q9WUS4 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Gja10Q9WUS4 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Gja10Q9WUS4 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Gja10Q9WUS4 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Gja10Q9WUS4 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
Gja10Q9WUS4 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Gja10Q9WUS4 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
Gja10Q9WUS4 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Gja10Q9WUS4 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Gja10Q9WUS4 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Gja10Q9WUS4 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Gja10Q9WUS4 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Gja10Q9WUS4 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Gja10Q9WUS4 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms