Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKI3

VPREB3, Pre-B lymphocyte protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB3Q9UKI3 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
VPREB3Q9UKI3 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
VPREB3Q9UKI3 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
VPREB3Q9UKI3 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
VPREB3Q9UKI3 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
VPREB3Q9UKI3 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
VPREB3Q9UKI3 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
VPREB3Q9UKI3 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
VPREB3Q9UKI3 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
VPREB3Q9UKI3 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
VPREB3Q9UKI3 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
VPREB3Q9UKI3 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
VPREB3Q9UKI3 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
VPREB3Q9UKI3 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
VPREB3Q9UKI3 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
VPREB3Q9UKI3 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
VPREB3Q9UKI3 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
VPREB3Q9UKI3 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
VPREB3Q9UKI3 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
VPREB3Q9UKI3 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
VPREB3Q9UKI3 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
VPREB3Q9UKI3 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
VPREB3Q9UKI3 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
VPREB3Q9UKI3 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
VPREB3Q9UKI3 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
VPREB3Q9UKI3 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
VPREB3Q9UKI3 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
VPREB3Q9UKI3 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
VPREB3Q9UKI3 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
VPREB3Q9UKI3 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
VPREB3Q9UKI3 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
VPREB3Q9UKI3 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
VPREB3Q9UKI3 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
VPREB3Q9UKI3 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
VPREB3Q9UKI3 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
VPREB3Q9UKI3 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
VPREB3Q9UKI3 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
VPREB3Q9UKI3 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
VPREB3Q9UKI3 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
VPREB3Q9UKI3 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
VPREB3Q9UKI3 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
VPREB3Q9UKI3 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
VPREB3Q9UKI3 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
VPREB3Q9UKI3 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
VPREB3Q9UKI3 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
VPREB3Q9UKI3 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
VPREB3Q9UKI3 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
VPREB3Q9UKI3 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
VPREB3Q9UKI3 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
VPREB3Q9UKI3 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
VPREB3Q9UKI3 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
VPREB3Q9UKI3 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
VPREB3Q9UKI3 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
VPREB3Q9UKI3 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
VPREB3Q9UKI3 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC19.84■□□□□ 0.77
VPREB3Q9UKI3 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
VPREB3Q9UKI3 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
VPREB3Q9UKI3 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC19.84■□□□□ 0.77
VPREB3Q9UKI3 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
VPREB3Q9UKI3 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
VPREB3Q9UKI3 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
VPREB3Q9UKI3 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
VPREB3Q9UKI3 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
VPREB3Q9UKI3 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
VPREB3Q9UKI3 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
VPREB3Q9UKI3 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
VPREB3Q9UKI3 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
VPREB3Q9UKI3 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
VPREB3Q9UKI3 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
VPREB3Q9UKI3 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
VPREB3Q9UKI3 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
VPREB3Q9UKI3 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
VPREB3Q9UKI3 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
VPREB3Q9UKI3 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
VPREB3Q9UKI3 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
VPREB3Q9UKI3 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
VPREB3Q9UKI3 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
VPREB3Q9UKI3 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
VPREB3Q9UKI3 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
VPREB3Q9UKI3 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
VPREB3Q9UKI3 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
VPREB3Q9UKI3 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
VPREB3Q9UKI3 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
VPREB3Q9UKI3 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
VPREB3Q9UKI3 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
VPREB3Q9UKI3 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
VPREB3Q9UKI3 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
VPREB3Q9UKI3 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
VPREB3Q9UKI3 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
VPREB3Q9UKI3 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
VPREB3Q9UKI3 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
VPREB3Q9UKI3 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
VPREB3Q9UKI3 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
VPREB3Q9UKI3 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
VPREB3Q9UKI3 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
VPREB3Q9UKI3 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
VPREB3Q9UKI3 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
VPREB3Q9UKI3 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
VPREB3Q9UKI3 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
VPREB3Q9UKI3 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 120.5 ms