Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E9

RRBP1, Ribosome-binding protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,410 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRBP1Q9P2E9 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.26■■■■□ 3.72
RRBP1Q9P2E9 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC38.26■■■■□ 3.72
RRBP1Q9P2E9 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC38.26■■■■□ 3.72
RRBP1Q9P2E9 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.26■■■■□ 3.71
RRBP1Q9P2E9 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC38.25■■■■□ 3.71
RRBP1Q9P2E9 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC38.25■■■■□ 3.71
RRBP1Q9P2E9 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC38.25■■■■□ 3.71
RRBP1Q9P2E9 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC38.25■■■■□ 3.71
RRBP1Q9P2E9 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC38.24■■■■□ 3.71
RRBP1Q9P2E9 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC38.24■■■■□ 3.71
RRBP1Q9P2E9 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.24■■■■□ 3.71
RRBP1Q9P2E9 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC38.23■■■■□ 3.71
RRBP1Q9P2E9 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC38.23■■■■□ 3.71
RRBP1Q9P2E9 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC38.23■■■■□ 3.71
RRBP1Q9P2E9 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.23■■■■□ 3.71
RRBP1Q9P2E9 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC38.22■■■■□ 3.71
RRBP1Q9P2E9 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.22■■■■□ 3.71
RRBP1Q9P2E9 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.21■■■■□ 3.71
RRBP1Q9P2E9 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.21■■■■□ 3.71
RRBP1Q9P2E9 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.21■■■■□ 3.71
RRBP1Q9P2E9 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.2■■■■□ 3.71
RRBP1Q9P2E9 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC38.18■■■■□ 3.7
RRBP1Q9P2E9 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.18■■■■□ 3.7
RRBP1Q9P2E9 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.18■■■■□ 3.7
RRBP1Q9P2E9 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC38.18■■■■□ 3.7
RRBP1Q9P2E9 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.18■■■■□ 3.7
RRBP1Q9P2E9 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.17■■■■□ 3.7
RRBP1Q9P2E9 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC38.17■■■■□ 3.7
RRBP1Q9P2E9 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.16■■■■□ 3.7
RRBP1Q9P2E9 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC38.15■■■■□ 3.7
RRBP1Q9P2E9 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.14■■■■□ 3.7
RRBP1Q9P2E9 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC38.14■■■■□ 3.7
RRBP1Q9P2E9 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC38.14■■■■□ 3.7
RRBP1Q9P2E9 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.14■■■■□ 3.7
RRBP1Q9P2E9 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.14■■■■□ 3.7
RRBP1Q9P2E9 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.14■■■■□ 3.7
RRBP1Q9P2E9 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC38.14■■■■□ 3.7
RRBP1Q9P2E9 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC38.13■■■■□ 3.7
RRBP1Q9P2E9 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.13■■■■□ 3.69
RRBP1Q9P2E9 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.13■■■■□ 3.69
RRBP1Q9P2E9 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.12■■■■□ 3.69
RRBP1Q9P2E9 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC38.12■■■■□ 3.69
RRBP1Q9P2E9 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC38.12■■■■□ 3.69
RRBP1Q9P2E9 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.11■■■■□ 3.69
RRBP1Q9P2E9 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC38.11■■■■□ 3.69
RRBP1Q9P2E9 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC38.11■■■■□ 3.69
RRBP1Q9P2E9 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.1■■■■□ 3.69
RRBP1Q9P2E9 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.09■■■■□ 3.69
RRBP1Q9P2E9 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC38.09■■■■□ 3.69
RRBP1Q9P2E9 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC38.09■■■■□ 3.69
RRBP1Q9P2E9 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.08■■■■□ 3.69
RRBP1Q9P2E9 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.07■■■■□ 3.68
RRBP1Q9P2E9 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC38.07■■■■□ 3.68
RRBP1Q9P2E9 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC38.06■■■■□ 3.68
RRBP1Q9P2E9 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC38.06■■■■□ 3.68
RRBP1Q9P2E9 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC38.05■■■■□ 3.68
RRBP1Q9P2E9 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC38.05■■■■□ 3.68
RRBP1Q9P2E9 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC38.04■■■■□ 3.68
RRBP1Q9P2E9 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC38.04■■■■□ 3.68
RRBP1Q9P2E9 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.04■■■■□ 3.68
RRBP1Q9P2E9 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC38.04■■■■□ 3.68
RRBP1Q9P2E9 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC38.02■■■■□ 3.68
RRBP1Q9P2E9 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.02■■■■□ 3.68
RRBP1Q9P2E9 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC38.02■■■■□ 3.68
RRBP1Q9P2E9 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.02■■■■□ 3.68
RRBP1Q9P2E9 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC38■■■■□ 3.67
RRBP1Q9P2E9 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38■■■■□ 3.67
RRBP1Q9P2E9 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.99■■■■□ 3.67
RRBP1Q9P2E9 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC37.99■■■■□ 3.67
RRBP1Q9P2E9 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.97■■■■□ 3.67
RRBP1Q9P2E9 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
RRBP1Q9P2E9 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
RRBP1Q9P2E9 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.96■■■■□ 3.67
RRBP1Q9P2E9 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC37.95■■■■□ 3.67
RRBP1Q9P2E9 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC37.95■■■■□ 3.67
RRBP1Q9P2E9 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC37.95■■■■□ 3.67
RRBP1Q9P2E9 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.95■■■■□ 3.67
RRBP1Q9P2E9 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.95■■■■□ 3.67
RRBP1Q9P2E9 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.95■■■■□ 3.67
RRBP1Q9P2E9 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.95■■■■□ 3.67
RRBP1Q9P2E9 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.95■■■■□ 3.67
RRBP1Q9P2E9 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.95■■■■□ 3.67
RRBP1Q9P2E9 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC37.95■■■■□ 3.67
RRBP1Q9P2E9 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.94■■■■□ 3.66
RRBP1Q9P2E9 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC37.94■■■■□ 3.66
RRBP1Q9P2E9 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.94■■■■□ 3.66
RRBP1Q9P2E9 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC37.93■■■■□ 3.66
RRBP1Q9P2E9 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.93■■■■□ 3.66
RRBP1Q9P2E9 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.93■■■■□ 3.66
RRBP1Q9P2E9 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC37.92■■■■□ 3.66
RRBP1Q9P2E9 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC37.92■■■■□ 3.66
RRBP1Q9P2E9 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.92■■■■□ 3.66
RRBP1Q9P2E9 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.91■■■■□ 3.66
RRBP1Q9P2E9 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.91■■■■□ 3.66
RRBP1Q9P2E9 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC37.91■■■■□ 3.66
RRBP1Q9P2E9 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC37.91■■■■□ 3.66
RRBP1Q9P2E9 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC37.91■■■■□ 3.66
RRBP1Q9P2E9 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC37.91■■■■□ 3.66
RRBP1Q9P2E9 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.91■■■■□ 3.66
RRBP1Q9P2E9 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC37.9■■■■□ 3.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms