Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z3

HCN3, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 3, humanhuman

Predictions only

Length 774 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCN3Q9P1Z3 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HCN3Q9P1Z3 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HCN3Q9P1Z3 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HCN3Q9P1Z3 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
HCN3Q9P1Z3 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
HCN3Q9P1Z3 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
HCN3Q9P1Z3 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
HCN3Q9P1Z3 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
HCN3Q9P1Z3 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HCN3Q9P1Z3 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HCN3Q9P1Z3 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HCN3Q9P1Z3 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
HCN3Q9P1Z3 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HCN3Q9P1Z3 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HCN3Q9P1Z3 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
HCN3Q9P1Z3 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
HCN3Q9P1Z3 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HCN3Q9P1Z3 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
HCN3Q9P1Z3 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
HCN3Q9P1Z3 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
HCN3Q9P1Z3 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HCN3Q9P1Z3 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
HCN3Q9P1Z3 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HCN3Q9P1Z3 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
HCN3Q9P1Z3 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
HCN3Q9P1Z3 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HCN3Q9P1Z3 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
HCN3Q9P1Z3 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HCN3Q9P1Z3 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HCN3Q9P1Z3 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HCN3Q9P1Z3 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HCN3Q9P1Z3 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
HCN3Q9P1Z3 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
HCN3Q9P1Z3 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
HCN3Q9P1Z3 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
HCN3Q9P1Z3 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
HCN3Q9P1Z3 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
HCN3Q9P1Z3 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
HCN3Q9P1Z3 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
HCN3Q9P1Z3 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
HCN3Q9P1Z3 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HCN3Q9P1Z3 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HCN3Q9P1Z3 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
HCN3Q9P1Z3 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HCN3Q9P1Z3 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
HCN3Q9P1Z3 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
HCN3Q9P1Z3 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HCN3Q9P1Z3 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
HCN3Q9P1Z3 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
HCN3Q9P1Z3 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
HCN3Q9P1Z3 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HCN3Q9P1Z3 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HCN3Q9P1Z3 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
HCN3Q9P1Z3 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
HCN3Q9P1Z3 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
HCN3Q9P1Z3 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HCN3Q9P1Z3 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HCN3Q9P1Z3 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HCN3Q9P1Z3 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HCN3Q9P1Z3 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HCN3Q9P1Z3 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HCN3Q9P1Z3 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HCN3Q9P1Z3 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HCN3Q9P1Z3 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HCN3Q9P1Z3 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HCN3Q9P1Z3 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
HCN3Q9P1Z3 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
HCN3Q9P1Z3 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
HCN3Q9P1Z3 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
HCN3Q9P1Z3 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
HCN3Q9P1Z3 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
HCN3Q9P1Z3 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.36
HCN3Q9P1Z3 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HCN3Q9P1Z3 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
HCN3Q9P1Z3 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HCN3Q9P1Z3 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HCN3Q9P1Z3 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HCN3Q9P1Z3 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HCN3Q9P1Z3 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HCN3Q9P1Z3 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HCN3Q9P1Z3 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HCN3Q9P1Z3 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HCN3Q9P1Z3 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HCN3Q9P1Z3 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HCN3Q9P1Z3 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HCN3Q9P1Z3 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
HCN3Q9P1Z3 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HCN3Q9P1Z3 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HCN3Q9P1Z3 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
HCN3Q9P1Z3 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HCN3Q9P1Z3 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HCN3Q9P1Z3 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HCN3Q9P1Z3 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HCN3Q9P1Z3 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HCN3Q9P1Z3 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HCN3Q9P1Z3 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HCN3Q9P1Z3 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HCN3Q9P1Z3 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HCN3Q9P1Z3 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HCN3Q9P1Z3 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms