Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY43

BARHL2, BarH-like 2 homeobox protein, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BARHL2Q9NY43 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
BARHL2Q9NY43 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
BARHL2Q9NY43 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
BARHL2Q9NY43 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
BARHL2Q9NY43 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
BARHL2Q9NY43 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
BARHL2Q9NY43 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
BARHL2Q9NY43 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
BARHL2Q9NY43 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
BARHL2Q9NY43 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
BARHL2Q9NY43 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
BARHL2Q9NY43 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC28.8■■■□□ 2.2
BARHL2Q9NY43 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
BARHL2Q9NY43 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
BARHL2Q9NY43 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
BARHL2Q9NY43 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
BARHL2Q9NY43 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
BARHL2Q9NY43 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
BARHL2Q9NY43 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.78■■■□□ 2.2
BARHL2Q9NY43 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
BARHL2Q9NY43 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
BARHL2Q9NY43 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
BARHL2Q9NY43 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
BARHL2Q9NY43 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
BARHL2Q9NY43 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
BARHL2Q9NY43 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
BARHL2Q9NY43 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
BARHL2Q9NY43 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
BARHL2Q9NY43 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
BARHL2Q9NY43 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
BARHL2Q9NY43 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
BARHL2Q9NY43 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
BARHL2Q9NY43 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
BARHL2Q9NY43 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
BARHL2Q9NY43 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
BARHL2Q9NY43 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
BARHL2Q9NY43 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
BARHL2Q9NY43 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
BARHL2Q9NY43 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
BARHL2Q9NY43 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
BARHL2Q9NY43 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
BARHL2Q9NY43 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
BARHL2Q9NY43 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
BARHL2Q9NY43 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
BARHL2Q9NY43 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
BARHL2Q9NY43 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
BARHL2Q9NY43 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
BARHL2Q9NY43 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
BARHL2Q9NY43 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
BARHL2Q9NY43 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
BARHL2Q9NY43 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
BARHL2Q9NY43 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
BARHL2Q9NY43 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
BARHL2Q9NY43 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
BARHL2Q9NY43 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
BARHL2Q9NY43 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
BARHL2Q9NY43 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
BARHL2Q9NY43 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
BARHL2Q9NY43 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
BARHL2Q9NY43 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
BARHL2Q9NY43 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
BARHL2Q9NY43 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
BARHL2Q9NY43 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
BARHL2Q9NY43 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
BARHL2Q9NY43 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
BARHL2Q9NY43 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
BARHL2Q9NY43 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
BARHL2Q9NY43 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
BARHL2Q9NY43 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
BARHL2Q9NY43 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
BARHL2Q9NY43 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
BARHL2Q9NY43 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
BARHL2Q9NY43 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC28.64■■■□□ 2.18
BARHL2Q9NY43 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
BARHL2Q9NY43 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
BARHL2Q9NY43 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
BARHL2Q9NY43 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
BARHL2Q9NY43 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
BARHL2Q9NY43 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
BARHL2Q9NY43 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
BARHL2Q9NY43 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
BARHL2Q9NY43 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
BARHL2Q9NY43 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
BARHL2Q9NY43 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
BARHL2Q9NY43 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
BARHL2Q9NY43 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
BARHL2Q9NY43 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
BARHL2Q9NY43 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
BARHL2Q9NY43 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
BARHL2Q9NY43 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
BARHL2Q9NY43 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
BARHL2Q9NY43 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
BARHL2Q9NY43 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
BARHL2Q9NY43 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
BARHL2Q9NY43 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
BARHL2Q9NY43 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
BARHL2Q9NY43 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
BARHL2Q9NY43 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
BARHL2Q9NY43 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
BARHL2Q9NY43 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13 ms