Protein–RNA interactions for Protein: Q9NV96

TMEM30A, Cell cycle control protein 50A, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM30AQ9NV96 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TMEM30AQ9NV96 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TMEM30AQ9NV96 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TMEM30AQ9NV96 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TMEM30AQ9NV96 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TMEM30AQ9NV96 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TMEM30AQ9NV96 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TMEM30AQ9NV96 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TMEM30AQ9NV96 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
TMEM30AQ9NV96 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
TMEM30AQ9NV96 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
TMEM30AQ9NV96 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
TMEM30AQ9NV96 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
TMEM30AQ9NV96 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
TMEM30AQ9NV96 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
TMEM30AQ9NV96 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TMEM30AQ9NV96 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TMEM30AQ9NV96 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TMEM30AQ9NV96 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TMEM30AQ9NV96 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TMEM30AQ9NV96 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TMEM30AQ9NV96 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TMEM30AQ9NV96 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TMEM30AQ9NV96 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TMEM30AQ9NV96 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TMEM30AQ9NV96 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
TMEM30AQ9NV96 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
TMEM30AQ9NV96 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
TMEM30AQ9NV96 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
TMEM30AQ9NV96 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TMEM30AQ9NV96 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TMEM30AQ9NV96 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TMEM30AQ9NV96 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TMEM30AQ9NV96 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TMEM30AQ9NV96 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
TMEM30AQ9NV96 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.81
TMEM30AQ9NV96 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
TMEM30AQ9NV96 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
TMEM30AQ9NV96 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
TMEM30AQ9NV96 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TMEM30AQ9NV96 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TMEM30AQ9NV96 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
TMEM30AQ9NV96 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
TMEM30AQ9NV96 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TMEM30AQ9NV96 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TMEM30AQ9NV96 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
TMEM30AQ9NV96 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
TMEM30AQ9NV96 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
TMEM30AQ9NV96 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TMEM30AQ9NV96 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
TMEM30AQ9NV96 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC26.34■■□□□ 1.81
TMEM30AQ9NV96 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC26.34■■□□□ 1.81
TMEM30AQ9NV96 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TMEM30AQ9NV96 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
TMEM30AQ9NV96 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
TMEM30AQ9NV96 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
TMEM30AQ9NV96 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
TMEM30AQ9NV96 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
TMEM30AQ9NV96 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TMEM30AQ9NV96 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
TMEM30AQ9NV96 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
TMEM30AQ9NV96 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
TMEM30AQ9NV96 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TMEM30AQ9NV96 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
TMEM30AQ9NV96 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
TMEM30AQ9NV96 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TMEM30AQ9NV96 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TMEM30AQ9NV96 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TMEM30AQ9NV96 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
TMEM30AQ9NV96 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
TMEM30AQ9NV96 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TMEM30AQ9NV96 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TMEM30AQ9NV96 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TMEM30AQ9NV96 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TMEM30AQ9NV96 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TMEM30AQ9NV96 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
TMEM30AQ9NV96 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TMEM30AQ9NV96 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
TMEM30AQ9NV96 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
TMEM30AQ9NV96 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
TMEM30AQ9NV96 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TMEM30AQ9NV96 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TMEM30AQ9NV96 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
TMEM30AQ9NV96 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
TMEM30AQ9NV96 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TMEM30AQ9NV96 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TMEM30AQ9NV96 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
TMEM30AQ9NV96 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
TMEM30AQ9NV96 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
TMEM30AQ9NV96 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TMEM30AQ9NV96 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TMEM30AQ9NV96 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TMEM30AQ9NV96 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TMEM30AQ9NV96 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TMEM30AQ9NV96 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
TMEM30AQ9NV96 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TMEM30AQ9NV96 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TMEM30AQ9NV96 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TMEM30AQ9NV96 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TMEM30AQ9NV96 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms