Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSB4

KRT82, Keratin, type II cuticular Hb2, humanhuman

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT82Q9NSB4 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
KRT82Q9NSB4 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
KRT82Q9NSB4 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
KRT82Q9NSB4 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
KRT82Q9NSB4 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
KRT82Q9NSB4 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
KRT82Q9NSB4 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
KRT82Q9NSB4 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.83
KRT82Q9NSB4 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
KRT82Q9NSB4 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
KRT82Q9NSB4 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.83
KRT82Q9NSB4 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
KRT82Q9NSB4 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
KRT82Q9NSB4 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
KRT82Q9NSB4 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
KRT82Q9NSB4 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
KRT82Q9NSB4 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
KRT82Q9NSB4 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
KRT82Q9NSB4 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
KRT82Q9NSB4 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
KRT82Q9NSB4 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
KRT82Q9NSB4 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
KRT82Q9NSB4 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
KRT82Q9NSB4 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
KRT82Q9NSB4 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
KRT82Q9NSB4 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
KRT82Q9NSB4 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
KRT82Q9NSB4 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
KRT82Q9NSB4 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
KRT82Q9NSB4 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
KRT82Q9NSB4 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
KRT82Q9NSB4 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
KRT82Q9NSB4 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
KRT82Q9NSB4 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
KRT82Q9NSB4 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
KRT82Q9NSB4 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
KRT82Q9NSB4 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
KRT82Q9NSB4 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
KRT82Q9NSB4 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
KRT82Q9NSB4 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
KRT82Q9NSB4 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
KRT82Q9NSB4 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
KRT82Q9NSB4 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
KRT82Q9NSB4 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
KRT82Q9NSB4 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
KRT82Q9NSB4 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
KRT82Q9NSB4 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
KRT82Q9NSB4 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
KRT82Q9NSB4 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
KRT82Q9NSB4 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
KRT82Q9NSB4 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
KRT82Q9NSB4 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
KRT82Q9NSB4 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
KRT82Q9NSB4 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
KRT82Q9NSB4 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
KRT82Q9NSB4 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
KRT82Q9NSB4 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
KRT82Q9NSB4 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
KRT82Q9NSB4 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
KRT82Q9NSB4 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
KRT82Q9NSB4 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
KRT82Q9NSB4 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
KRT82Q9NSB4 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
KRT82Q9NSB4 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
KRT82Q9NSB4 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
KRT82Q9NSB4 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
KRT82Q9NSB4 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
KRT82Q9NSB4 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
KRT82Q9NSB4 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
KRT82Q9NSB4 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
KRT82Q9NSB4 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
KRT82Q9NSB4 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
KRT82Q9NSB4 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
KRT82Q9NSB4 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
KRT82Q9NSB4 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
KRT82Q9NSB4 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
KRT82Q9NSB4 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
KRT82Q9NSB4 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
KRT82Q9NSB4 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
KRT82Q9NSB4 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
KRT82Q9NSB4 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
KRT82Q9NSB4 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
KRT82Q9NSB4 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
KRT82Q9NSB4 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
KRT82Q9NSB4 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
KRT82Q9NSB4 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
KRT82Q9NSB4 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
KRT82Q9NSB4 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
KRT82Q9NSB4 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
KRT82Q9NSB4 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
KRT82Q9NSB4 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
KRT82Q9NSB4 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
KRT82Q9NSB4 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
KRT82Q9NSB4 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
KRT82Q9NSB4 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
KRT82Q9NSB4 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
KRT82Q9NSB4 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
KRT82Q9NSB4 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
KRT82Q9NSB4 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
KRT82Q9NSB4 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms