Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ36

SCUBE2, Signal peptide, CUB and EGF-like domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 999 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCUBE2Q9NQ36 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SCUBE2Q9NQ36 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SCUBE2Q9NQ36 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SCUBE2Q9NQ36 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SCUBE2Q9NQ36 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SCUBE2Q9NQ36 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SCUBE2Q9NQ36 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SCUBE2Q9NQ36 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SCUBE2Q9NQ36 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SCUBE2Q9NQ36 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SCUBE2Q9NQ36 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SCUBE2Q9NQ36 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SCUBE2Q9NQ36 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SCUBE2Q9NQ36 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SCUBE2Q9NQ36 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SCUBE2Q9NQ36 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SCUBE2Q9NQ36 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SCUBE2Q9NQ36 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SCUBE2Q9NQ36 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SCUBE2Q9NQ36 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SCUBE2Q9NQ36 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SCUBE2Q9NQ36 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SCUBE2Q9NQ36 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SCUBE2Q9NQ36 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SCUBE2Q9NQ36 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SCUBE2Q9NQ36 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SCUBE2Q9NQ36 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SCUBE2Q9NQ36 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SCUBE2Q9NQ36 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
SCUBE2Q9NQ36 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SCUBE2Q9NQ36 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SCUBE2Q9NQ36 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SCUBE2Q9NQ36 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SCUBE2Q9NQ36 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SCUBE2Q9NQ36 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SCUBE2Q9NQ36 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SCUBE2Q9NQ36 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SCUBE2Q9NQ36 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SCUBE2Q9NQ36 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SCUBE2Q9NQ36 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SCUBE2Q9NQ36 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SCUBE2Q9NQ36 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SCUBE2Q9NQ36 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SCUBE2Q9NQ36 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SCUBE2Q9NQ36 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SCUBE2Q9NQ36 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SCUBE2Q9NQ36 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SCUBE2Q9NQ36 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SCUBE2Q9NQ36 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SCUBE2Q9NQ36 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SCUBE2Q9NQ36 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SCUBE2Q9NQ36 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SCUBE2Q9NQ36 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SCUBE2Q9NQ36 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SCUBE2Q9NQ36 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SCUBE2Q9NQ36 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SCUBE2Q9NQ36 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SCUBE2Q9NQ36 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SCUBE2Q9NQ36 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SCUBE2Q9NQ36 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SCUBE2Q9NQ36 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SCUBE2Q9NQ36 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SCUBE2Q9NQ36 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SCUBE2Q9NQ36 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SCUBE2Q9NQ36 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SCUBE2Q9NQ36 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SCUBE2Q9NQ36 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SCUBE2Q9NQ36 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SCUBE2Q9NQ36 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SCUBE2Q9NQ36 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SCUBE2Q9NQ36 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SCUBE2Q9NQ36 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SCUBE2Q9NQ36 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SCUBE2Q9NQ36 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SCUBE2Q9NQ36 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SCUBE2Q9NQ36 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SCUBE2Q9NQ36 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SCUBE2Q9NQ36 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SCUBE2Q9NQ36 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SCUBE2Q9NQ36 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SCUBE2Q9NQ36 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SCUBE2Q9NQ36 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SCUBE2Q9NQ36 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SCUBE2Q9NQ36 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SCUBE2Q9NQ36 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SCUBE2Q9NQ36 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SCUBE2Q9NQ36 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SCUBE2Q9NQ36 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SCUBE2Q9NQ36 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SCUBE2Q9NQ36 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SCUBE2Q9NQ36 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SCUBE2Q9NQ36 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SCUBE2Q9NQ36 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SCUBE2Q9NQ36 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SCUBE2Q9NQ36 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SCUBE2Q9NQ36 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SCUBE2Q9NQ36 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
SCUBE2Q9NQ36 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SCUBE2Q9NQ36 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
SCUBE2Q9NQ36 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.5 ms