Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPR4

Rpl17, 60S ribosomal protein L17, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 184 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl17Q9CPR4 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rpl17Q9CPR4 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Rpl17Q9CPR4 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Rpl17Q9CPR4 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Rpl17Q9CPR4 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rpl17Q9CPR4 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rpl17Q9CPR4 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rpl17Q9CPR4 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rpl17Q9CPR4 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rpl17Q9CPR4 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rpl17Q9CPR4 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rpl17Q9CPR4 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rpl17Q9CPR4 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rpl17Q9CPR4 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rpl17Q9CPR4 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rpl17Q9CPR4 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
Rpl17Q9CPR4 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Rpl17Q9CPR4 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Rpl17Q9CPR4 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Rpl17Q9CPR4 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Rpl17Q9CPR4 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Rpl17Q9CPR4 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Rpl17Q9CPR4 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rpl17Q9CPR4 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rpl17Q9CPR4 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rpl17Q9CPR4 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rpl17Q9CPR4 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rpl17Q9CPR4 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Rpl17Q9CPR4 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Rpl17Q9CPR4 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Rpl17Q9CPR4 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Rpl17Q9CPR4 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Rpl17Q9CPR4 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Rpl17Q9CPR4 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Rpl17Q9CPR4 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Rpl17Q9CPR4 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Rpl17Q9CPR4 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Rpl17Q9CPR4 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Rpl17Q9CPR4 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rpl17Q9CPR4 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rpl17Q9CPR4 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rpl17Q9CPR4 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rpl17Q9CPR4 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rpl17Q9CPR4 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rpl17Q9CPR4 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rpl17Q9CPR4 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rpl17Q9CPR4 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rpl17Q9CPR4 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Rpl17Q9CPR4 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Rpl17Q9CPR4 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Rpl17Q9CPR4 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Rpl17Q9CPR4 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Rpl17Q9CPR4 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Rpl17Q9CPR4 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rpl17Q9CPR4 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rpl17Q9CPR4 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Rpl17Q9CPR4 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Rpl17Q9CPR4 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Rpl17Q9CPR4 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Rpl17Q9CPR4 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rpl17Q9CPR4 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rpl17Q9CPR4 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rpl17Q9CPR4 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rpl17Q9CPR4 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rpl17Q9CPR4 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rpl17Q9CPR4 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rpl17Q9CPR4 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rpl17Q9CPR4 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rpl17Q9CPR4 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Rpl17Q9CPR4 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rpl17Q9CPR4 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rpl17Q9CPR4 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rpl17Q9CPR4 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Rpl17Q9CPR4 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Rpl17Q9CPR4 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Rpl17Q9CPR4 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Rpl17Q9CPR4 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Rpl17Q9CPR4 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Rpl17Q9CPR4 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Rpl17Q9CPR4 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Rpl17Q9CPR4 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Rpl17Q9CPR4 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Rpl17Q9CPR4 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Rpl17Q9CPR4 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Rpl17Q9CPR4 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Rpl17Q9CPR4 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rpl17Q9CPR4 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rpl17Q9CPR4 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rpl17Q9CPR4 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rpl17Q9CPR4 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Rpl17Q9CPR4 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rpl17Q9CPR4 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rpl17Q9CPR4 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rpl17Q9CPR4 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rpl17Q9CPR4 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rpl17Q9CPR4 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rpl17Q9CPR4 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rpl17Q9CPR4 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rpl17Q9CPR4 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rpl17Q9CPR4 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
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