Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW66

CINP, Cyclin-dependent kinase 2-interacting protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CINPQ9BW66 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CINPQ9BW66 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CINPQ9BW66 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CINPQ9BW66 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CINPQ9BW66 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CINPQ9BW66 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CINPQ9BW66 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CINPQ9BW66 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CINPQ9BW66 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CINPQ9BW66 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CINPQ9BW66 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CINPQ9BW66 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CINPQ9BW66 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CINPQ9BW66 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CINPQ9BW66 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CINPQ9BW66 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CINPQ9BW66 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CINPQ9BW66 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CINPQ9BW66 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CINPQ9BW66 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CINPQ9BW66 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CINPQ9BW66 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CINPQ9BW66 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CINPQ9BW66 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CINPQ9BW66 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CINPQ9BW66 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CINPQ9BW66 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CINPQ9BW66 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CINPQ9BW66 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CINPQ9BW66 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.65
CINPQ9BW66 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CINPQ9BW66 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CINPQ9BW66 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CINPQ9BW66 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CINPQ9BW66 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CINPQ9BW66 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CINPQ9BW66 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CINPQ9BW66 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CINPQ9BW66 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CINPQ9BW66 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CINPQ9BW66 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CINPQ9BW66 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CINPQ9BW66 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CINPQ9BW66 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CINPQ9BW66 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CINPQ9BW66 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CINPQ9BW66 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CINPQ9BW66 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CINPQ9BW66 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CINPQ9BW66 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CINPQ9BW66 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CINPQ9BW66 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CINPQ9BW66 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CINPQ9BW66 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CINPQ9BW66 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CINPQ9BW66 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
CINPQ9BW66 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CINPQ9BW66 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
CINPQ9BW66 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CINPQ9BW66 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CINPQ9BW66 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CINPQ9BW66 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CINPQ9BW66 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CINPQ9BW66 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CINPQ9BW66 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CINPQ9BW66 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CINPQ9BW66 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CINPQ9BW66 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CINPQ9BW66 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CINPQ9BW66 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CINPQ9BW66 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CINPQ9BW66 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
CINPQ9BW66 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CINPQ9BW66 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CINPQ9BW66 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CINPQ9BW66 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CINPQ9BW66 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CINPQ9BW66 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CINPQ9BW66 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CINPQ9BW66 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
CINPQ9BW66 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CINPQ9BW66 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CINPQ9BW66 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CINPQ9BW66 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CINPQ9BW66 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CINPQ9BW66 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CINPQ9BW66 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CINPQ9BW66 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CINPQ9BW66 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CINPQ9BW66 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CINPQ9BW66 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CINPQ9BW66 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CINPQ9BW66 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CINPQ9BW66 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CINPQ9BW66 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
CINPQ9BW66 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
CINPQ9BW66 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CINPQ9BW66 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CINPQ9BW66 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CINPQ9BW66 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms