Protein–RNA interactions for Protein: Q96KP6

TNIP3, TNFAIP3-interacting protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNIP3Q96KP6 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TNIP3Q96KP6 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TNIP3Q96KP6 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TNIP3Q96KP6 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
TNIP3Q96KP6 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
TNIP3Q96KP6 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TNIP3Q96KP6 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
TNIP3Q96KP6 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TNIP3Q96KP6 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
TNIP3Q96KP6 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
TNIP3Q96KP6 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TNIP3Q96KP6 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
TNIP3Q96KP6 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TNIP3Q96KP6 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TNIP3Q96KP6 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
TNIP3Q96KP6 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
TNIP3Q96KP6 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TNIP3Q96KP6 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
TNIP3Q96KP6 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TNIP3Q96KP6 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC26.59■■□□□ 1.85
TNIP3Q96KP6 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
TNIP3Q96KP6 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TNIP3Q96KP6 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TNIP3Q96KP6 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
TNIP3Q96KP6 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
TNIP3Q96KP6 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
TNIP3Q96KP6 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
TNIP3Q96KP6 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
TNIP3Q96KP6 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
TNIP3Q96KP6 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TNIP3Q96KP6 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TNIP3Q96KP6 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
TNIP3Q96KP6 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TNIP3Q96KP6 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
TNIP3Q96KP6 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
TNIP3Q96KP6 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
TNIP3Q96KP6 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TNIP3Q96KP6 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
TNIP3Q96KP6 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TNIP3Q96KP6 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TNIP3Q96KP6 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TNIP3Q96KP6 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
TNIP3Q96KP6 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
TNIP3Q96KP6 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TNIP3Q96KP6 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
TNIP3Q96KP6 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
TNIP3Q96KP6 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TNIP3Q96KP6 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
TNIP3Q96KP6 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
TNIP3Q96KP6 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
TNIP3Q96KP6 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TNIP3Q96KP6 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
TNIP3Q96KP6 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
TNIP3Q96KP6 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TNIP3Q96KP6 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TNIP3Q96KP6 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
TNIP3Q96KP6 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TNIP3Q96KP6 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TNIP3Q96KP6 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TNIP3Q96KP6 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
TNIP3Q96KP6 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TNIP3Q96KP6 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TNIP3Q96KP6 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TNIP3Q96KP6 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TNIP3Q96KP6 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TNIP3Q96KP6 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TNIP3Q96KP6 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TNIP3Q96KP6 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TNIP3Q96KP6 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TNIP3Q96KP6 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TNIP3Q96KP6 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TNIP3Q96KP6 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TNIP3Q96KP6 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TNIP3Q96KP6 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TNIP3Q96KP6 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TNIP3Q96KP6 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TNIP3Q96KP6 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TNIP3Q96KP6 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TNIP3Q96KP6 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TNIP3Q96KP6 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
TNIP3Q96KP6 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
TNIP3Q96KP6 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TNIP3Q96KP6 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TNIP3Q96KP6 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TNIP3Q96KP6 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TNIP3Q96KP6 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TNIP3Q96KP6 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TNIP3Q96KP6 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
TNIP3Q96KP6 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TNIP3Q96KP6 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
TNIP3Q96KP6 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TNIP3Q96KP6 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TNIP3Q96KP6 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TNIP3Q96KP6 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TNIP3Q96KP6 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TNIP3Q96KP6 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
TNIP3Q96KP6 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TNIP3Q96KP6 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
TNIP3Q96KP6 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.82
TNIP3Q96KP6 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms