Protein–RNA interactions for Protein: Q96E22

NUS1, Dehydrodolichyl diphosphate synthase complex subunit NUS1, humanhuman

Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUS1Q96E22 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NUS1Q96E22 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NUS1Q96E22 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NUS1Q96E22 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NUS1Q96E22 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NUS1Q96E22 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NUS1Q96E22 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NUS1Q96E22 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NUS1Q96E22 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NUS1Q96E22 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NUS1Q96E22 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NUS1Q96E22 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
NUS1Q96E22 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
NUS1Q96E22 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
NUS1Q96E22 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
NUS1Q96E22 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
NUS1Q96E22 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NUS1Q96E22 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
NUS1Q96E22 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NUS1Q96E22 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NUS1Q96E22 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NUS1Q96E22 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NUS1Q96E22 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NUS1Q96E22 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NUS1Q96E22 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NUS1Q96E22 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
NUS1Q96E22 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NUS1Q96E22 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NUS1Q96E22 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NUS1Q96E22 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NUS1Q96E22 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NUS1Q96E22 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NUS1Q96E22 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NUS1Q96E22 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NUS1Q96E22 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
NUS1Q96E22 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NUS1Q96E22 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NUS1Q96E22 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NUS1Q96E22 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NUS1Q96E22 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
NUS1Q96E22 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
NUS1Q96E22 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NUS1Q96E22 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NUS1Q96E22 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NUS1Q96E22 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NUS1Q96E22 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NUS1Q96E22 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NUS1Q96E22 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NUS1Q96E22 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
NUS1Q96E22 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NUS1Q96E22 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NUS1Q96E22 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NUS1Q96E22 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NUS1Q96E22 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NUS1Q96E22 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
NUS1Q96E22 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NUS1Q96E22 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NUS1Q96E22 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NUS1Q96E22 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NUS1Q96E22 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NUS1Q96E22 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
NUS1Q96E22 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NUS1Q96E22 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NUS1Q96E22 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
NUS1Q96E22 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NUS1Q96E22 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NUS1Q96E22 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NUS1Q96E22 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NUS1Q96E22 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NUS1Q96E22 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NUS1Q96E22 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NUS1Q96E22 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NUS1Q96E22 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NUS1Q96E22 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NUS1Q96E22 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
NUS1Q96E22 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NUS1Q96E22 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NUS1Q96E22 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NUS1Q96E22 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
NUS1Q96E22 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NUS1Q96E22 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NUS1Q96E22 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NUS1Q96E22 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NUS1Q96E22 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NUS1Q96E22 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NUS1Q96E22 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NUS1Q96E22 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NUS1Q96E22 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NUS1Q96E22 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NUS1Q96E22 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NUS1Q96E22 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NUS1Q96E22 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
NUS1Q96E22 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
NUS1Q96E22 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NUS1Q96E22 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NUS1Q96E22 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
NUS1Q96E22 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NUS1Q96E22 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NUS1Q96E22 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
NUS1Q96E22 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.2 ms