Protein–RNA interactions for Protein: Q969K3

RNF34, E3 ubiquitin-protein ligase RNF34, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF34Q969K3 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
RNF34Q969K3 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RNF34Q969K3 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
RNF34Q969K3 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RNF34Q969K3 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RNF34Q969K3 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RNF34Q969K3 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
RNF34Q969K3 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RNF34Q969K3 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
RNF34Q969K3 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RNF34Q969K3 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RNF34Q969K3 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
RNF34Q969K3 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
RNF34Q969K3 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
RNF34Q969K3 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
RNF34Q969K3 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
RNF34Q969K3 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
RNF34Q969K3 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
RNF34Q969K3 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
RNF34Q969K3 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
RNF34Q969K3 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RNF34Q969K3 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
RNF34Q969K3 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RNF34Q969K3 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RNF34Q969K3 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
RNF34Q969K3 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RNF34Q969K3 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RNF34Q969K3 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
RNF34Q969K3 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
RNF34Q969K3 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
RNF34Q969K3 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
RNF34Q969K3 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
RNF34Q969K3 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RNF34Q969K3 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RNF34Q969K3 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
RNF34Q969K3 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RNF34Q969K3 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RNF34Q969K3 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RNF34Q969K3 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
RNF34Q969K3 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RNF34Q969K3 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RNF34Q969K3 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RNF34Q969K3 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RNF34Q969K3 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
RNF34Q969K3 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
RNF34Q969K3 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
RNF34Q969K3 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RNF34Q969K3 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RNF34Q969K3 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
RNF34Q969K3 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RNF34Q969K3 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
RNF34Q969K3 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
RNF34Q969K3 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
RNF34Q969K3 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
RNF34Q969K3 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
RNF34Q969K3 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
RNF34Q969K3 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
RNF34Q969K3 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RNF34Q969K3 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RNF34Q969K3 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
RNF34Q969K3 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RNF34Q969K3 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RNF34Q969K3 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
RNF34Q969K3 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RNF34Q969K3 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RNF34Q969K3 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RNF34Q969K3 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RNF34Q969K3 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RNF34Q969K3 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
RNF34Q969K3 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
RNF34Q969K3 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
RNF34Q969K3 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
RNF34Q969K3 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RNF34Q969K3 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RNF34Q969K3 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
RNF34Q969K3 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
RNF34Q969K3 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
RNF34Q969K3 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
RNF34Q969K3 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
RNF34Q969K3 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
RNF34Q969K3 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
RNF34Q969K3 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
RNF34Q969K3 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
RNF34Q969K3 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
RNF34Q969K3 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
RNF34Q969K3 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RNF34Q969K3 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
RNF34Q969K3 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
RNF34Q969K3 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RNF34Q969K3 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RNF34Q969K3 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RNF34Q969K3 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RNF34Q969K3 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
RNF34Q969K3 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
RNF34Q969K3 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
RNF34Q969K3 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
RNF34Q969K3 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RNF34Q969K3 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RNF34Q969K3 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
RNF34Q969K3 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms