Protein–RNA interactions for Protein: Q969I6

SLC38A4, Sodium-coupled neutral amino acid transporter 4, humanhuman

Predictions only

Length 547 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC38A4Q969I6 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC38A4Q969I6 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC38A4Q969I6 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC38A4Q969I6 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC38A4Q969I6 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC38A4Q969I6 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC38A4Q969I6 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC38A4Q969I6 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC38A4Q969I6 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC38A4Q969I6 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC38A4Q969I6 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC38A4Q969I6 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC38A4Q969I6 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC38A4Q969I6 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC38A4Q969I6 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC38A4Q969I6 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC38A4Q969I6 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC38A4Q969I6 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC38A4Q969I6 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC38A4Q969I6 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC38A4Q969I6 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC38A4Q969I6 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC38A4Q969I6 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC38A4Q969I6 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC38A4Q969I6 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC38A4Q969I6 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC38A4Q969I6 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC38A4Q969I6 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC38A4Q969I6 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC38A4Q969I6 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC38A4Q969I6 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC38A4Q969I6 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC38A4Q969I6 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC38A4Q969I6 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC38A4Q969I6 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC38A4Q969I6 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC38A4Q969I6 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC38A4Q969I6 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC38A4Q969I6 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC38A4Q969I6 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SLC38A4Q969I6 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SLC38A4Q969I6 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SLC38A4Q969I6 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC38A4Q969I6 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC38A4Q969I6 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC38A4Q969I6 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC38A4Q969I6 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC38A4Q969I6 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC38A4Q969I6 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC38A4Q969I6 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC38A4Q969I6 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC38A4Q969I6 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC38A4Q969I6 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC38A4Q969I6 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC38A4Q969I6 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC38A4Q969I6 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC38A4Q969I6 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC38A4Q969I6 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC38A4Q969I6 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC38A4Q969I6 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC38A4Q969I6 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC38A4Q969I6 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC38A4Q969I6 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC38A4Q969I6 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC38A4Q969I6 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC38A4Q969I6 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC38A4Q969I6 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC38A4Q969I6 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC38A4Q969I6 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC38A4Q969I6 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC38A4Q969I6 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC38A4Q969I6 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC38A4Q969I6 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC38A4Q969I6 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC38A4Q969I6 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC38A4Q969I6 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC38A4Q969I6 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC38A4Q969I6 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC38A4Q969I6 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC38A4Q969I6 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC38A4Q969I6 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC38A4Q969I6 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC38A4Q969I6 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC38A4Q969I6 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC38A4Q969I6 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC38A4Q969I6 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC38A4Q969I6 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC38A4Q969I6 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC38A4Q969I6 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC38A4Q969I6 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC38A4Q969I6 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC38A4Q969I6 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC38A4Q969I6 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC38A4Q969I6 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC38A4Q969I6 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SLC38A4Q969I6 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
SLC38A4Q969I6 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC38A4Q969I6 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC38A4Q969I6 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC38A4Q969I6 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.6 ms