Protein–RNA interactions for Protein: Q969D9

TSLP, Thymic stromal lymphopoietin, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSLPQ969D9 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TSLPQ969D9 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TSLPQ969D9 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TSLPQ969D9 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TSLPQ969D9 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TSLPQ969D9 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TSLPQ969D9 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TSLPQ969D9 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TSLPQ969D9 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
TSLPQ969D9 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TSLPQ969D9 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TSLPQ969D9 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TSLPQ969D9 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TSLPQ969D9 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TSLPQ969D9 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TSLPQ969D9 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TSLPQ969D9 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TSLPQ969D9 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
TSLPQ969D9 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TSLPQ969D9 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TSLPQ969D9 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TSLPQ969D9 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TSLPQ969D9 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TSLPQ969D9 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TSLPQ969D9 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TSLPQ969D9 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TSLPQ969D9 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TSLPQ969D9 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TSLPQ969D9 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TSLPQ969D9 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TSLPQ969D9 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TSLPQ969D9 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TSLPQ969D9 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TSLPQ969D9 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TSLPQ969D9 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TSLPQ969D9 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TSLPQ969D9 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TSLPQ969D9 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TSLPQ969D9 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TSLPQ969D9 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TSLPQ969D9 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TSLPQ969D9 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TSLPQ969D9 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TSLPQ969D9 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TSLPQ969D9 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TSLPQ969D9 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TSLPQ969D9 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TSLPQ969D9 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TSLPQ969D9 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
TSLPQ969D9 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
TSLPQ969D9 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
TSLPQ969D9 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
TSLPQ969D9 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TSLPQ969D9 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TSLPQ969D9 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TSLPQ969D9 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TSLPQ969D9 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TSLPQ969D9 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TSLPQ969D9 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TSLPQ969D9 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
TSLPQ969D9 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TSLPQ969D9 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TSLPQ969D9 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
TSLPQ969D9 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TSLPQ969D9 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TSLPQ969D9 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TSLPQ969D9 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TSLPQ969D9 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TSLPQ969D9 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TSLPQ969D9 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TSLPQ969D9 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TSLPQ969D9 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TSLPQ969D9 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TSLPQ969D9 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
TSLPQ969D9 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
TSLPQ969D9 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TSLPQ969D9 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TSLPQ969D9 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TSLPQ969D9 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TSLPQ969D9 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TSLPQ969D9 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TSLPQ969D9 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
TSLPQ969D9 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TSLPQ969D9 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TSLPQ969D9 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TSLPQ969D9 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TSLPQ969D9 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TSLPQ969D9 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TSLPQ969D9 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TSLPQ969D9 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TSLPQ969D9 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TSLPQ969D9 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
TSLPQ969D9 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TSLPQ969D9 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TSLPQ969D9 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TSLPQ969D9 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TSLPQ969D9 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TSLPQ969D9 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TSLPQ969D9 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TSLPQ969D9 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 181.7 ms