Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUM0

NUP133, Nuclear pore complex protein Nup133, humanhuman

Predictions only

Length 1,156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP133Q8WUM0 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
NUP133Q8WUM0 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
NUP133Q8WUM0 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC29.34■■■□□ 2.29
NUP133Q8WUM0 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
NUP133Q8WUM0 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
NUP133Q8WUM0 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
NUP133Q8WUM0 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
NUP133Q8WUM0 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
NUP133Q8WUM0 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
NUP133Q8WUM0 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
NUP133Q8WUM0 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC29.33■■■□□ 2.29
NUP133Q8WUM0 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
NUP133Q8WUM0 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
NUP133Q8WUM0 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
NUP133Q8WUM0 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.32■■■□□ 2.28
NUP133Q8WUM0 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
NUP133Q8WUM0 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
NUP133Q8WUM0 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
NUP133Q8WUM0 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
NUP133Q8WUM0 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
NUP133Q8WUM0 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
NUP133Q8WUM0 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
NUP133Q8WUM0 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
NUP133Q8WUM0 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
NUP133Q8WUM0 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
NUP133Q8WUM0 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
NUP133Q8WUM0 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
NUP133Q8WUM0 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
NUP133Q8WUM0 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
NUP133Q8WUM0 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
NUP133Q8WUM0 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
NUP133Q8WUM0 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
NUP133Q8WUM0 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
NUP133Q8WUM0 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
NUP133Q8WUM0 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
NUP133Q8WUM0 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
NUP133Q8WUM0 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
NUP133Q8WUM0 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
NUP133Q8WUM0 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC29.26■■■□□ 2.28
NUP133Q8WUM0 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
NUP133Q8WUM0 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
NUP133Q8WUM0 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
NUP133Q8WUM0 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.27
NUP133Q8WUM0 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.27
NUP133Q8WUM0 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
NUP133Q8WUM0 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
NUP133Q8WUM0 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
NUP133Q8WUM0 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
NUP133Q8WUM0 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
NUP133Q8WUM0 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC29.24■■■□□ 2.27
NUP133Q8WUM0 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
NUP133Q8WUM0 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
NUP133Q8WUM0 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC29.23■■■□□ 2.27
NUP133Q8WUM0 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
NUP133Q8WUM0 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
NUP133Q8WUM0 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
NUP133Q8WUM0 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC29.22■■■□□ 2.27
NUP133Q8WUM0 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
NUP133Q8WUM0 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
NUP133Q8WUM0 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
NUP133Q8WUM0 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
NUP133Q8WUM0 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
NUP133Q8WUM0 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC29.21■■■□□ 2.27
NUP133Q8WUM0 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
NUP133Q8WUM0 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
NUP133Q8WUM0 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
NUP133Q8WUM0 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
NUP133Q8WUM0 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
NUP133Q8WUM0 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
NUP133Q8WUM0 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
NUP133Q8WUM0 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
NUP133Q8WUM0 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
NUP133Q8WUM0 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC29.19■■■□□ 2.26
NUP133Q8WUM0 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
NUP133Q8WUM0 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
NUP133Q8WUM0 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
NUP133Q8WUM0 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
NUP133Q8WUM0 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
NUP133Q8WUM0 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC29.17■■■□□ 2.26
NUP133Q8WUM0 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
NUP133Q8WUM0 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
NUP133Q8WUM0 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
NUP133Q8WUM0 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
NUP133Q8WUM0 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
NUP133Q8WUM0 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
NUP133Q8WUM0 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
NUP133Q8WUM0 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC29.15■■■□□ 2.26
NUP133Q8WUM0 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
NUP133Q8WUM0 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
NUP133Q8WUM0 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
NUP133Q8WUM0 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
NUP133Q8WUM0 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
NUP133Q8WUM0 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
NUP133Q8WUM0 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
NUP133Q8WUM0 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
NUP133Q8WUM0 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
NUP133Q8WUM0 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
NUP133Q8WUM0 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
NUP133Q8WUM0 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
NUP133Q8WUM0 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10 ms