Protein–RNA interactions for Protein: Q8TB24

RIN3, Ras and Rab interactor 3, humanhuman

Predictions only

Length 985 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIN3Q8TB24 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RIN3Q8TB24 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RIN3Q8TB24 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RIN3Q8TB24 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RIN3Q8TB24 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RIN3Q8TB24 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RIN3Q8TB24 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
RIN3Q8TB24 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RIN3Q8TB24 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
RIN3Q8TB24 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RIN3Q8TB24 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
RIN3Q8TB24 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
RIN3Q8TB24 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
RIN3Q8TB24 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RIN3Q8TB24 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
RIN3Q8TB24 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RIN3Q8TB24 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RIN3Q8TB24 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
RIN3Q8TB24 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
RIN3Q8TB24 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
RIN3Q8TB24 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
RIN3Q8TB24 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
RIN3Q8TB24 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
RIN3Q8TB24 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
RIN3Q8TB24 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RIN3Q8TB24 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
RIN3Q8TB24 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RIN3Q8TB24 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
RIN3Q8TB24 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RIN3Q8TB24 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RIN3Q8TB24 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
RIN3Q8TB24 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
RIN3Q8TB24 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
RIN3Q8TB24 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RIN3Q8TB24 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RIN3Q8TB24 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
RIN3Q8TB24 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
RIN3Q8TB24 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RIN3Q8TB24 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RIN3Q8TB24 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RIN3Q8TB24 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RIN3Q8TB24 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RIN3Q8TB24 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
RIN3Q8TB24 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
RIN3Q8TB24 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RIN3Q8TB24 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
RIN3Q8TB24 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
RIN3Q8TB24 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
RIN3Q8TB24 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
RIN3Q8TB24 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
RIN3Q8TB24 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
RIN3Q8TB24 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RIN3Q8TB24 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RIN3Q8TB24 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
RIN3Q8TB24 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
RIN3Q8TB24 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
RIN3Q8TB24 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RIN3Q8TB24 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
RIN3Q8TB24 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
RIN3Q8TB24 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RIN3Q8TB24 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RIN3Q8TB24 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RIN3Q8TB24 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RIN3Q8TB24 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RIN3Q8TB24 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
RIN3Q8TB24 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RIN3Q8TB24 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RIN3Q8TB24 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
RIN3Q8TB24 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RIN3Q8TB24 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RIN3Q8TB24 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RIN3Q8TB24 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
RIN3Q8TB24 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
RIN3Q8TB24 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
RIN3Q8TB24 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
RIN3Q8TB24 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
RIN3Q8TB24 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
RIN3Q8TB24 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
RIN3Q8TB24 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
RIN3Q8TB24 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
RIN3Q8TB24 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
RIN3Q8TB24 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RIN3Q8TB24 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
RIN3Q8TB24 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RIN3Q8TB24 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
RIN3Q8TB24 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RIN3Q8TB24 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
RIN3Q8TB24 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
RIN3Q8TB24 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
RIN3Q8TB24 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RIN3Q8TB24 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RIN3Q8TB24 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RIN3Q8TB24 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
RIN3Q8TB24 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC25.86■■□□□ 1.73
RIN3Q8TB24 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
RIN3Q8TB24 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
RIN3Q8TB24 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
RIN3Q8TB24 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RIN3Q8TB24 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RIN3Q8TB24 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms