Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFU1

BEST2, Bestrophin-2, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEST2Q8NFU1 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
BEST2Q8NFU1 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
BEST2Q8NFU1 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
BEST2Q8NFU1 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
BEST2Q8NFU1 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
BEST2Q8NFU1 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
BEST2Q8NFU1 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
BEST2Q8NFU1 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
BEST2Q8NFU1 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
BEST2Q8NFU1 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
BEST2Q8NFU1 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
BEST2Q8NFU1 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
BEST2Q8NFU1 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
BEST2Q8NFU1 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
BEST2Q8NFU1 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
BEST2Q8NFU1 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
BEST2Q8NFU1 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
BEST2Q8NFU1 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
BEST2Q8NFU1 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
BEST2Q8NFU1 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
BEST2Q8NFU1 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
BEST2Q8NFU1 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
BEST2Q8NFU1 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
BEST2Q8NFU1 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
BEST2Q8NFU1 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
BEST2Q8NFU1 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
BEST2Q8NFU1 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.9
BEST2Q8NFU1 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
BEST2Q8NFU1 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
BEST2Q8NFU1 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
BEST2Q8NFU1 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
BEST2Q8NFU1 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
BEST2Q8NFU1 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
BEST2Q8NFU1 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
BEST2Q8NFU1 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
BEST2Q8NFU1 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
BEST2Q8NFU1 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
BEST2Q8NFU1 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
BEST2Q8NFU1 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
BEST2Q8NFU1 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
BEST2Q8NFU1 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
BEST2Q8NFU1 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
BEST2Q8NFU1 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
BEST2Q8NFU1 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
BEST2Q8NFU1 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
BEST2Q8NFU1 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
BEST2Q8NFU1 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
BEST2Q8NFU1 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
BEST2Q8NFU1 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
BEST2Q8NFU1 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
BEST2Q8NFU1 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
BEST2Q8NFU1 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
BEST2Q8NFU1 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
BEST2Q8NFU1 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
BEST2Q8NFU1 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
BEST2Q8NFU1 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
BEST2Q8NFU1 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
BEST2Q8NFU1 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
BEST2Q8NFU1 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
BEST2Q8NFU1 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
BEST2Q8NFU1 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
BEST2Q8NFU1 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
BEST2Q8NFU1 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
BEST2Q8NFU1 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
BEST2Q8NFU1 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
BEST2Q8NFU1 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
BEST2Q8NFU1 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
BEST2Q8NFU1 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
BEST2Q8NFU1 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
BEST2Q8NFU1 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
BEST2Q8NFU1 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
BEST2Q8NFU1 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
BEST2Q8NFU1 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
BEST2Q8NFU1 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
BEST2Q8NFU1 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
BEST2Q8NFU1 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
BEST2Q8NFU1 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
BEST2Q8NFU1 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
BEST2Q8NFU1 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
BEST2Q8NFU1 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
BEST2Q8NFU1 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
BEST2Q8NFU1 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
BEST2Q8NFU1 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
BEST2Q8NFU1 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
BEST2Q8NFU1 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
BEST2Q8NFU1 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
BEST2Q8NFU1 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
BEST2Q8NFU1 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
BEST2Q8NFU1 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
BEST2Q8NFU1 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
BEST2Q8NFU1 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
BEST2Q8NFU1 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
BEST2Q8NFU1 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
BEST2Q8NFU1 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
BEST2Q8NFU1 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
BEST2Q8NFU1 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
BEST2Q8NFU1 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
BEST2Q8NFU1 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
BEST2Q8NFU1 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
BEST2Q8NFU1 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms