Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEM0

MCPH1, Microcephalin, humanhuman

Predictions only

Length 835 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCPH1Q8NEM0 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
MCPH1Q8NEM0 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
MCPH1Q8NEM0 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
MCPH1Q8NEM0 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
MCPH1Q8NEM0 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
MCPH1Q8NEM0 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
MCPH1Q8NEM0 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
MCPH1Q8NEM0 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
MCPH1Q8NEM0 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
MCPH1Q8NEM0 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
MCPH1Q8NEM0 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
MCPH1Q8NEM0 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
MCPH1Q8NEM0 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
MCPH1Q8NEM0 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC27.7■■■□□ 2.02
MCPH1Q8NEM0 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
MCPH1Q8NEM0 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
MCPH1Q8NEM0 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
MCPH1Q8NEM0 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
MCPH1Q8NEM0 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
MCPH1Q8NEM0 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
MCPH1Q8NEM0 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
MCPH1Q8NEM0 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
MCPH1Q8NEM0 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
MCPH1Q8NEM0 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
MCPH1Q8NEM0 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
MCPH1Q8NEM0 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
MCPH1Q8NEM0 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
MCPH1Q8NEM0 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
MCPH1Q8NEM0 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
MCPH1Q8NEM0 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
MCPH1Q8NEM0 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
MCPH1Q8NEM0 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
MCPH1Q8NEM0 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
MCPH1Q8NEM0 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
MCPH1Q8NEM0 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
MCPH1Q8NEM0 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
MCPH1Q8NEM0 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
MCPH1Q8NEM0 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
MCPH1Q8NEM0 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
MCPH1Q8NEM0 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
MCPH1Q8NEM0 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
MCPH1Q8NEM0 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
MCPH1Q8NEM0 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
MCPH1Q8NEM0 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
MCPH1Q8NEM0 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
MCPH1Q8NEM0 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
MCPH1Q8NEM0 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
MCPH1Q8NEM0 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
MCPH1Q8NEM0 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
MCPH1Q8NEM0 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
MCPH1Q8NEM0 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
MCPH1Q8NEM0 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
MCPH1Q8NEM0 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
MCPH1Q8NEM0 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
MCPH1Q8NEM0 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
MCPH1Q8NEM0 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
MCPH1Q8NEM0 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
MCPH1Q8NEM0 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
MCPH1Q8NEM0 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
MCPH1Q8NEM0 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
MCPH1Q8NEM0 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
MCPH1Q8NEM0 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
MCPH1Q8NEM0 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
MCPH1Q8NEM0 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
MCPH1Q8NEM0 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
MCPH1Q8NEM0 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
MCPH1Q8NEM0 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC27.57■■■□□ 2
MCPH1Q8NEM0 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
MCPH1Q8NEM0 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
MCPH1Q8NEM0 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC27.56■■■□□ 2
MCPH1Q8NEM0 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
MCPH1Q8NEM0 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
MCPH1Q8NEM0 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
MCPH1Q8NEM0 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC27.55■■■□□ 2
MCPH1Q8NEM0 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
MCPH1Q8NEM0 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
MCPH1Q8NEM0 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
MCPH1Q8NEM0 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
MCPH1Q8NEM0 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
MCPH1Q8NEM0 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
MCPH1Q8NEM0 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
MCPH1Q8NEM0 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
MCPH1Q8NEM0 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
MCPH1Q8NEM0 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
MCPH1Q8NEM0 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
MCPH1Q8NEM0 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
MCPH1Q8NEM0 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
MCPH1Q8NEM0 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
MCPH1Q8NEM0 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
MCPH1Q8NEM0 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
MCPH1Q8NEM0 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
MCPH1Q8NEM0 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
MCPH1Q8NEM0 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
MCPH1Q8NEM0 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
MCPH1Q8NEM0 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
MCPH1Q8NEM0 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
MCPH1Q8NEM0 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
MCPH1Q8NEM0 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
MCPH1Q8NEM0 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
MCPH1Q8NEM0 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms