Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3S3

PHTF2, Putative homeodomain transcription factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 785 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHTF2Q8N3S3 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PHTF2Q8N3S3 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PHTF2Q8N3S3 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PHTF2Q8N3S3 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PHTF2Q8N3S3 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
PHTF2Q8N3S3 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PHTF2Q8N3S3 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PHTF2Q8N3S3 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PHTF2Q8N3S3 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PHTF2Q8N3S3 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PHTF2Q8N3S3 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PHTF2Q8N3S3 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PHTF2Q8N3S3 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PHTF2Q8N3S3 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
PHTF2Q8N3S3 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PHTF2Q8N3S3 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PHTF2Q8N3S3 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PHTF2Q8N3S3 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
PHTF2Q8N3S3 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PHTF2Q8N3S3 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PHTF2Q8N3S3 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PHTF2Q8N3S3 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PHTF2Q8N3S3 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PHTF2Q8N3S3 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PHTF2Q8N3S3 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
PHTF2Q8N3S3 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PHTF2Q8N3S3 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PHTF2Q8N3S3 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PHTF2Q8N3S3 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
PHTF2Q8N3S3 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PHTF2Q8N3S3 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PHTF2Q8N3S3 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PHTF2Q8N3S3 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PHTF2Q8N3S3 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
PHTF2Q8N3S3 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PHTF2Q8N3S3 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PHTF2Q8N3S3 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
PHTF2Q8N3S3 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PHTF2Q8N3S3 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PHTF2Q8N3S3 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PHTF2Q8N3S3 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
PHTF2Q8N3S3 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PHTF2Q8N3S3 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PHTF2Q8N3S3 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PHTF2Q8N3S3 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PHTF2Q8N3S3 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PHTF2Q8N3S3 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PHTF2Q8N3S3 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PHTF2Q8N3S3 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PHTF2Q8N3S3 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PHTF2Q8N3S3 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
PHTF2Q8N3S3 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PHTF2Q8N3S3 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PHTF2Q8N3S3 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PHTF2Q8N3S3 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PHTF2Q8N3S3 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PHTF2Q8N3S3 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PHTF2Q8N3S3 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PHTF2Q8N3S3 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PHTF2Q8N3S3 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PHTF2Q8N3S3 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PHTF2Q8N3S3 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PHTF2Q8N3S3 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PHTF2Q8N3S3 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PHTF2Q8N3S3 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PHTF2Q8N3S3 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PHTF2Q8N3S3 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PHTF2Q8N3S3 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PHTF2Q8N3S3 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PHTF2Q8N3S3 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
PHTF2Q8N3S3 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PHTF2Q8N3S3 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PHTF2Q8N3S3 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PHTF2Q8N3S3 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PHTF2Q8N3S3 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PHTF2Q8N3S3 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PHTF2Q8N3S3 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PHTF2Q8N3S3 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PHTF2Q8N3S3 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PHTF2Q8N3S3 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PHTF2Q8N3S3 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PHTF2Q8N3S3 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PHTF2Q8N3S3 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PHTF2Q8N3S3 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PHTF2Q8N3S3 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PHTF2Q8N3S3 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PHTF2Q8N3S3 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PHTF2Q8N3S3 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PHTF2Q8N3S3 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PHTF2Q8N3S3 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PHTF2Q8N3S3 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PHTF2Q8N3S3 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PHTF2Q8N3S3 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
PHTF2Q8N3S3 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PHTF2Q8N3S3 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PHTF2Q8N3S3 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PHTF2Q8N3S3 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PHTF2Q8N3S3 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PHTF2Q8N3S3 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PHTF2Q8N3S3 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms