Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTT9

SLC29A4, Equilibrative nucleoside transporter 4, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC29A4Q7RTT9 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC29A4Q7RTT9 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC29A4Q7RTT9 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC29A4Q7RTT9 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC29A4Q7RTT9 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC29A4Q7RTT9 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC29A4Q7RTT9 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC29A4Q7RTT9 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC29A4Q7RTT9 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC29A4Q7RTT9 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC29A4Q7RTT9 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC29A4Q7RTT9 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC29A4Q7RTT9 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC29A4Q7RTT9 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC29A4Q7RTT9 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC29A4Q7RTT9 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC29A4Q7RTT9 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC29A4Q7RTT9 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC29A4Q7RTT9 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC29A4Q7RTT9 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC29A4Q7RTT9 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC29A4Q7RTT9 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC29A4Q7RTT9 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC29A4Q7RTT9 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC29A4Q7RTT9 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC29A4Q7RTT9 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC29A4Q7RTT9 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC29A4Q7RTT9 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC29A4Q7RTT9 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC29A4Q7RTT9 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC29A4Q7RTT9 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC29A4Q7RTT9 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC29A4Q7RTT9 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC29A4Q7RTT9 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC29A4Q7RTT9 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC29A4Q7RTT9 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC29A4Q7RTT9 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC29A4Q7RTT9 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC29A4Q7RTT9 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC29A4Q7RTT9 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC29A4Q7RTT9 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC29A4Q7RTT9 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC29A4Q7RTT9 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SLC29A4Q7RTT9 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SLC29A4Q7RTT9 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC29A4Q7RTT9 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC29A4Q7RTT9 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC29A4Q7RTT9 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC29A4Q7RTT9 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC29A4Q7RTT9 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC29A4Q7RTT9 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC29A4Q7RTT9 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC29A4Q7RTT9 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC29A4Q7RTT9 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC29A4Q7RTT9 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC29A4Q7RTT9 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC29A4Q7RTT9 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC29A4Q7RTT9 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC29A4Q7RTT9 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC29A4Q7RTT9 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC29A4Q7RTT9 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC29A4Q7RTT9 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC29A4Q7RTT9 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC29A4Q7RTT9 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC29A4Q7RTT9 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC29A4Q7RTT9 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC29A4Q7RTT9 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC29A4Q7RTT9 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC29A4Q7RTT9 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC29A4Q7RTT9 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC29A4Q7RTT9 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC29A4Q7RTT9 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC29A4Q7RTT9 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC29A4Q7RTT9 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC29A4Q7RTT9 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC29A4Q7RTT9 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC29A4Q7RTT9 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC29A4Q7RTT9 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC29A4Q7RTT9 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC29A4Q7RTT9 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC29A4Q7RTT9 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC29A4Q7RTT9 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC29A4Q7RTT9 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC29A4Q7RTT9 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC29A4Q7RTT9 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC29A4Q7RTT9 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC29A4Q7RTT9 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC29A4Q7RTT9 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC29A4Q7RTT9 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC29A4Q7RTT9 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC29A4Q7RTT9 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC29A4Q7RTT9 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC29A4Q7RTT9 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC29A4Q7RTT9 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC29A4Q7RTT9 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC29A4Q7RTT9 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC29A4Q7RTT9 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC29A4Q7RTT9 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC29A4Q7RTT9 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC29A4Q7RTT9 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms