Protein–RNA interactions for Protein: Q6KAU4

Mvb12b, Multivesicular body subunit 12B, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mvb12bQ6KAU4 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Mvb12bQ6KAU4 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Mvb12bQ6KAU4 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Mvb12bQ6KAU4 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Mvb12bQ6KAU4 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Mvb12bQ6KAU4 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Mvb12bQ6KAU4 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Mvb12bQ6KAU4 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Mvb12bQ6KAU4 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Mvb12bQ6KAU4 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Mvb12bQ6KAU4 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Mvb12bQ6KAU4 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Mvb12bQ6KAU4 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Mvb12bQ6KAU4 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Mvb12bQ6KAU4 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Mvb12bQ6KAU4 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Mvb12bQ6KAU4 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Mvb12bQ6KAU4 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Mvb12bQ6KAU4 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Mvb12bQ6KAU4 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Mvb12bQ6KAU4 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Mvb12bQ6KAU4 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Mvb12bQ6KAU4 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Mvb12bQ6KAU4 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Mvb12bQ6KAU4 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Mvb12bQ6KAU4 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Mvb12bQ6KAU4 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Mvb12bQ6KAU4 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Mvb12bQ6KAU4 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Mvb12bQ6KAU4 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Mvb12bQ6KAU4 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Mvb12bQ6KAU4 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Mvb12bQ6KAU4 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Mvb12bQ6KAU4 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Mvb12bQ6KAU4 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Mvb12bQ6KAU4 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Mvb12bQ6KAU4 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Mvb12bQ6KAU4 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Mvb12bQ6KAU4 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Mvb12bQ6KAU4 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Mvb12bQ6KAU4 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Mvb12bQ6KAU4 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Mvb12bQ6KAU4 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Mvb12bQ6KAU4 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Mvb12bQ6KAU4 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Mvb12bQ6KAU4 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Mvb12bQ6KAU4 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Mvb12bQ6KAU4 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Mvb12bQ6KAU4 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Mvb12bQ6KAU4 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Mvb12bQ6KAU4 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Mvb12bQ6KAU4 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Mvb12bQ6KAU4 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Mvb12bQ6KAU4 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Mvb12bQ6KAU4 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Mvb12bQ6KAU4 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Mvb12bQ6KAU4 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Mvb12bQ6KAU4 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Mvb12bQ6KAU4 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Mvb12bQ6KAU4 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Mvb12bQ6KAU4 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Mvb12bQ6KAU4 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Mvb12bQ6KAU4 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Mvb12bQ6KAU4 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Mvb12bQ6KAU4 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Mvb12bQ6KAU4 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Mvb12bQ6KAU4 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Mvb12bQ6KAU4 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Mvb12bQ6KAU4 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Mvb12bQ6KAU4 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Mvb12bQ6KAU4 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Mvb12bQ6KAU4 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Mvb12bQ6KAU4 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Mvb12bQ6KAU4 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Mvb12bQ6KAU4 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Mvb12bQ6KAU4 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Mvb12bQ6KAU4 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Mvb12bQ6KAU4 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Mvb12bQ6KAU4 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Mvb12bQ6KAU4 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Mvb12bQ6KAU4 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Mvb12bQ6KAU4 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Mvb12bQ6KAU4 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Mvb12bQ6KAU4 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Mvb12bQ6KAU4 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Mvb12bQ6KAU4 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Mvb12bQ6KAU4 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Mvb12bQ6KAU4 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Mvb12bQ6KAU4 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Mvb12bQ6KAU4 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Mvb12bQ6KAU4 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Mvb12bQ6KAU4 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Mvb12bQ6KAU4 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Mvb12bQ6KAU4 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Mvb12bQ6KAU4 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Mvb12bQ6KAU4 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Mvb12bQ6KAU4 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Mvb12bQ6KAU4 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Mvb12bQ6KAU4 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Mvb12bQ6KAU4 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.4 ms