Protein–RNA interactions for Protein: Q6IR41

C1qtnf6, Complement C1q tumor necrosis factor-related protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1qtnf6Q6IR41 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
C1qtnf6Q6IR41 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
C1qtnf6Q6IR41 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
C1qtnf6Q6IR41 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
C1qtnf6Q6IR41 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
C1qtnf6Q6IR41 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
C1qtnf6Q6IR41 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
C1qtnf6Q6IR41 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
C1qtnf6Q6IR41 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
C1qtnf6Q6IR41 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
C1qtnf6Q6IR41 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
C1qtnf6Q6IR41 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
C1qtnf6Q6IR41 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
C1qtnf6Q6IR41 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
C1qtnf6Q6IR41 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
C1qtnf6Q6IR41 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
C1qtnf6Q6IR41 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
C1qtnf6Q6IR41 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
C1qtnf6Q6IR41 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
C1qtnf6Q6IR41 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
C1qtnf6Q6IR41 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
C1qtnf6Q6IR41 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
C1qtnf6Q6IR41 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
C1qtnf6Q6IR41 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
C1qtnf6Q6IR41 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
C1qtnf6Q6IR41 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
C1qtnf6Q6IR41 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
C1qtnf6Q6IR41 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
C1qtnf6Q6IR41 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
C1qtnf6Q6IR41 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
C1qtnf6Q6IR41 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
C1qtnf6Q6IR41 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
C1qtnf6Q6IR41 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
C1qtnf6Q6IR41 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
C1qtnf6Q6IR41 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
C1qtnf6Q6IR41 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
C1qtnf6Q6IR41 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
C1qtnf6Q6IR41 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
C1qtnf6Q6IR41 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
C1qtnf6Q6IR41 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
C1qtnf6Q6IR41 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
C1qtnf6Q6IR41 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
C1qtnf6Q6IR41 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
C1qtnf6Q6IR41 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
C1qtnf6Q6IR41 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
C1qtnf6Q6IR41 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
C1qtnf6Q6IR41 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
C1qtnf6Q6IR41 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
C1qtnf6Q6IR41 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
C1qtnf6Q6IR41 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
C1qtnf6Q6IR41 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
C1qtnf6Q6IR41 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
C1qtnf6Q6IR41 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
C1qtnf6Q6IR41 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
C1qtnf6Q6IR41 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
C1qtnf6Q6IR41 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
C1qtnf6Q6IR41 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
C1qtnf6Q6IR41 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
C1qtnf6Q6IR41 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
C1qtnf6Q6IR41 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
C1qtnf6Q6IR41 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
C1qtnf6Q6IR41 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
C1qtnf6Q6IR41 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
C1qtnf6Q6IR41 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
C1qtnf6Q6IR41 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
C1qtnf6Q6IR41 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
C1qtnf6Q6IR41 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
C1qtnf6Q6IR41 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
C1qtnf6Q6IR41 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
C1qtnf6Q6IR41 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
C1qtnf6Q6IR41 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
C1qtnf6Q6IR41 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
C1qtnf6Q6IR41 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
C1qtnf6Q6IR41 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
C1qtnf6Q6IR41 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
C1qtnf6Q6IR41 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
C1qtnf6Q6IR41 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
C1qtnf6Q6IR41 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
C1qtnf6Q6IR41 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
C1qtnf6Q6IR41 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
C1qtnf6Q6IR41 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
C1qtnf6Q6IR41 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
C1qtnf6Q6IR41 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
C1qtnf6Q6IR41 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
C1qtnf6Q6IR41 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
C1qtnf6Q6IR41 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
C1qtnf6Q6IR41 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
C1qtnf6Q6IR41 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
C1qtnf6Q6IR41 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
C1qtnf6Q6IR41 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
C1qtnf6Q6IR41 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
C1qtnf6Q6IR41 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
C1qtnf6Q6IR41 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
C1qtnf6Q6IR41 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
C1qtnf6Q6IR41 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
C1qtnf6Q6IR41 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
C1qtnf6Q6IR41 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
C1qtnf6Q6IR41 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
C1qtnf6Q6IR41 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
C1qtnf6Q6IR41 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 117.4 ms