Protein–RNA interactions for Protein: Q6IBW4

NCAPH2, Condensin-2 complex subunit H2, humanhuman

Predictions only

Length 605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAPH2Q6IBW4 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
NCAPH2Q6IBW4 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
NCAPH2Q6IBW4 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
NCAPH2Q6IBW4 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
NCAPH2Q6IBW4 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
NCAPH2Q6IBW4 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
NCAPH2Q6IBW4 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
NCAPH2Q6IBW4 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
NCAPH2Q6IBW4 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
NCAPH2Q6IBW4 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
NCAPH2Q6IBW4 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
NCAPH2Q6IBW4 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
NCAPH2Q6IBW4 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
NCAPH2Q6IBW4 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
NCAPH2Q6IBW4 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
NCAPH2Q6IBW4 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
NCAPH2Q6IBW4 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC28.18■■■□□ 2.1
NCAPH2Q6IBW4 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
NCAPH2Q6IBW4 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
NCAPH2Q6IBW4 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
NCAPH2Q6IBW4 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
NCAPH2Q6IBW4 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
NCAPH2Q6IBW4 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
NCAPH2Q6IBW4 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
NCAPH2Q6IBW4 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
NCAPH2Q6IBW4 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
NCAPH2Q6IBW4 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC28.16■■■□□ 2.1
NCAPH2Q6IBW4 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
NCAPH2Q6IBW4 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
NCAPH2Q6IBW4 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
NCAPH2Q6IBW4 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
NCAPH2Q6IBW4 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
NCAPH2Q6IBW4 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
NCAPH2Q6IBW4 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
NCAPH2Q6IBW4 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
NCAPH2Q6IBW4 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
NCAPH2Q6IBW4 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
NCAPH2Q6IBW4 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
NCAPH2Q6IBW4 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
NCAPH2Q6IBW4 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
NCAPH2Q6IBW4 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
NCAPH2Q6IBW4 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
NCAPH2Q6IBW4 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
NCAPH2Q6IBW4 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
NCAPH2Q6IBW4 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
NCAPH2Q6IBW4 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
NCAPH2Q6IBW4 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
NCAPH2Q6IBW4 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
NCAPH2Q6IBW4 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
NCAPH2Q6IBW4 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
NCAPH2Q6IBW4 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
NCAPH2Q6IBW4 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
NCAPH2Q6IBW4 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
NCAPH2Q6IBW4 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
NCAPH2Q6IBW4 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
NCAPH2Q6IBW4 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
NCAPH2Q6IBW4 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
NCAPH2Q6IBW4 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
NCAPH2Q6IBW4 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
NCAPH2Q6IBW4 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
NCAPH2Q6IBW4 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
NCAPH2Q6IBW4 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
NCAPH2Q6IBW4 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
NCAPH2Q6IBW4 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
NCAPH2Q6IBW4 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
NCAPH2Q6IBW4 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
NCAPH2Q6IBW4 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
NCAPH2Q6IBW4 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
NCAPH2Q6IBW4 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
NCAPH2Q6IBW4 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
NCAPH2Q6IBW4 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
NCAPH2Q6IBW4 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
NCAPH2Q6IBW4 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
NCAPH2Q6IBW4 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
NCAPH2Q6IBW4 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
NCAPH2Q6IBW4 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
NCAPH2Q6IBW4 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
NCAPH2Q6IBW4 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
NCAPH2Q6IBW4 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
NCAPH2Q6IBW4 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
NCAPH2Q6IBW4 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
NCAPH2Q6IBW4 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
NCAPH2Q6IBW4 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
NCAPH2Q6IBW4 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
NCAPH2Q6IBW4 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
NCAPH2Q6IBW4 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
NCAPH2Q6IBW4 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
NCAPH2Q6IBW4 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
NCAPH2Q6IBW4 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
NCAPH2Q6IBW4 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
NCAPH2Q6IBW4 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC28.01■■■□□ 2.07
NCAPH2Q6IBW4 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
NCAPH2Q6IBW4 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
NCAPH2Q6IBW4 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC28■■■□□ 2.07
NCAPH2Q6IBW4 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC28■■■□□ 2.07
NCAPH2Q6IBW4 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
NCAPH2Q6IBW4 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
NCAPH2Q6IBW4 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
NCAPH2Q6IBW4 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
NCAPH2Q6IBW4 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.3 ms