Protein–RNA interactions for Protein: Q61457

Ccne1, G1/S-specific cyclin-E1, mousemouse

Predictions only

Length 408 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccne1Q61457 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC30,22■■■□□ 2,43
Ccne1Q61457 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,22■■■□□ 2,43
Ccne1Q61457 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC30,21■■■□□ 2,43
Ccne1Q61457 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC30,21■■■□□ 2,43
Ccne1Q61457 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC30,21■■■□□ 2,43
Ccne1Q61457 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30,2■■■□□ 2,43
Ccne1Q61457 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,2■■■□□ 2,43
Ccne1Q61457 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC30,2■■■□□ 2,43
Ccne1Q61457 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,2■■■□□ 2,42
Ccne1Q61457 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,19■■■□□ 2,42
Ccne1Q61457 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,19■■■□□ 2,42
Ccne1Q61457 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC30,18■■■□□ 2,42
Ccne1Q61457 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,18■■■□□ 2,42
Ccne1Q61457 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC30,18■■■□□ 2,42
Ccne1Q61457 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,17■■■□□ 2,42
Ccne1Q61457 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC30,17■■■□□ 2,42
Ccne1Q61457 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,16■■■□□ 2,42
Ccne1Q61457 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC30,16■■■□□ 2,42
Ccne1Q61457 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC30,16■■■□□ 2,42
Ccne1Q61457 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,15■■■□□ 2,42
Ccne1Q61457 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC30,15■■■□□ 2,42
Ccne1Q61457 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC30,15■■■□□ 2,42
Ccne1Q61457 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC30,15■■■□□ 2,42
Ccne1Q61457 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30,15■■■□□ 2,42
Ccne1Q61457 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC30,14■■■□□ 2,42
Ccne1Q61457 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC30,14■■■□□ 2,42
Ccne1Q61457 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,14■■■□□ 2,42
Ccne1Q61457 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30,13■■■□□ 2,41
Ccne1Q61457 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,13■■■□□ 2,41
Ccne1Q61457 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC30,12■■■□□ 2,41
Ccne1Q61457 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC30,12■■■□□ 2,41
Ccne1Q61457 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,12■■■□□ 2,41
Ccne1Q61457 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC30,11■■■□□ 2,41
Ccne1Q61457 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,11■■■□□ 2,41
Ccne1Q61457 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,1■■■□□ 2,41
Ccne1Q61457 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC30,1■■■□□ 2,41
Ccne1Q61457 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC30,08■■■□□ 2,41
Ccne1Q61457 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30,08■■■□□ 2,41
Ccne1Q61457 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30,08■■■□□ 2,41
Ccne1Q61457 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC30,07■■■□□ 2,4
Ccne1Q61457 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC30,06■■■□□ 2,4
Ccne1Q61457 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC30,06■■■□□ 2,4
Ccne1Q61457 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30,06■■■□□ 2,4
Ccne1Q61457 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30,05■■■□□ 2,4
Ccne1Q61457 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,05■■■□□ 2,4
Ccne1Q61457 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC30,05■■■□□ 2,4
Ccne1Q61457 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,04■■■□□ 2,4
Ccne1Q61457 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30,04■■■□□ 2,4
Ccne1Q61457 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC30,04■■■□□ 2,4
Ccne1Q61457 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,04■■■□□ 2,4
Ccne1Q61457 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30,03■■■□□ 2,4
Ccne1Q61457 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC30,03■■■□□ 2,4
Ccne1Q61457 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30,03■■■□□ 2,4
Ccne1Q61457 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC30,02■■■□□ 2,4
Ccne1Q61457 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2,39
Ccne1Q61457 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30■■■□□ 2,39
Ccne1Q61457 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2,39
Ccne1Q61457 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC29,99■■■□□ 2,39
Ccne1Q61457 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,99■■■□□ 2,39
Ccne1Q61457 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC29,99■■■□□ 2,39
Ccne1Q61457 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC29,99■■■□□ 2,39
Ccne1Q61457 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC29,98■■■□□ 2,39
Ccne1Q61457 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC29,98■■■□□ 2,39
Ccne1Q61457 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC29,98■■■□□ 2,39
Ccne1Q61457 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,98■■■□□ 2,39
Ccne1Q61457 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC29,97■■■□□ 2,39
Ccne1Q61457 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29,96■■■□□ 2,39
Ccne1Q61457 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,96■■■□□ 2,39
Ccne1Q61457 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,96■■■□□ 2,39
Ccne1Q61457 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,96■■■□□ 2,39
Ccne1Q61457 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC29,96■■■□□ 2,39
Ccne1Q61457 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,96■■■□□ 2,39
Ccne1Q61457 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,96■■■□□ 2,39
Ccne1Q61457 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29,95■■■□□ 2,38
Ccne1Q61457 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,95■■■□□ 2,38
Ccne1Q61457 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC29,94■■■□□ 2,38
Ccne1Q61457 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,94■■■□□ 2,38
Ccne1Q61457 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,94■■■□□ 2,38
Ccne1Q61457 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC29,94■■■□□ 2,38
Ccne1Q61457 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC29,93■■■□□ 2,38
Ccne1Q61457 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC29,93■■■□□ 2,38
Ccne1Q61457 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC29,93■■■□□ 2,38
Ccne1Q61457 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,92■■■□□ 2,38
Ccne1Q61457 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC29,92■■■□□ 2,38
Ccne1Q61457 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29,92■■■□□ 2,38
Ccne1Q61457 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,92■■■□□ 2,38
Ccne1Q61457 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,91■■■□□ 2,38
Ccne1Q61457 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,91■■■□□ 2,38
Ccne1Q61457 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,9■■■□□ 2,38
Ccne1Q61457 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29,9■■■□□ 2,38
Ccne1Q61457 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,9■■■□□ 2,38
Ccne1Q61457 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,89■■■□□ 2,38
Ccne1Q61457 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC29,89■■■□□ 2,38
Ccne1Q61457 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC29,89■■■□□ 2,38
Ccne1Q61457 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,89■■■□□ 2,38
Ccne1Q61457 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC29,89■■■□□ 2,37
Ccne1Q61457 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC29,87■■■□□ 2,37
Ccne1Q61457 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29,86■■■□□ 2,37
Ccne1Q61457 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,86■■■□□ 2,37
Ccne1Q61457 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC29,85■■■□□ 2,37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24,4 ms