Protein–RNA interactions for Protein: Q5VXT5

SYPL2, Synaptophysin-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 272 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYPL2Q5VXT5 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SYPL2Q5VXT5 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SYPL2Q5VXT5 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SYPL2Q5VXT5 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SYPL2Q5VXT5 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SYPL2Q5VXT5 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SYPL2Q5VXT5 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SYPL2Q5VXT5 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SYPL2Q5VXT5 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SYPL2Q5VXT5 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
SYPL2Q5VXT5 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
SYPL2Q5VXT5 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SYPL2Q5VXT5 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SYPL2Q5VXT5 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SYPL2Q5VXT5 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SYPL2Q5VXT5 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SYPL2Q5VXT5 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SYPL2Q5VXT5 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SYPL2Q5VXT5 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SYPL2Q5VXT5 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SYPL2Q5VXT5 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SYPL2Q5VXT5 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SYPL2Q5VXT5 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SYPL2Q5VXT5 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SYPL2Q5VXT5 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SYPL2Q5VXT5 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SYPL2Q5VXT5 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SYPL2Q5VXT5 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SYPL2Q5VXT5 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SYPL2Q5VXT5 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SYPL2Q5VXT5 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SYPL2Q5VXT5 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SYPL2Q5VXT5 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SYPL2Q5VXT5 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SYPL2Q5VXT5 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SYPL2Q5VXT5 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SYPL2Q5VXT5 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SYPL2Q5VXT5 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SYPL2Q5VXT5 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SYPL2Q5VXT5 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SYPL2Q5VXT5 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SYPL2Q5VXT5 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SYPL2Q5VXT5 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SYPL2Q5VXT5 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SYPL2Q5VXT5 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SYPL2Q5VXT5 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SYPL2Q5VXT5 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SYPL2Q5VXT5 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SYPL2Q5VXT5 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SYPL2Q5VXT5 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SYPL2Q5VXT5 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SYPL2Q5VXT5 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SYPL2Q5VXT5 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SYPL2Q5VXT5 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SYPL2Q5VXT5 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SYPL2Q5VXT5 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SYPL2Q5VXT5 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SYPL2Q5VXT5 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SYPL2Q5VXT5 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SYPL2Q5VXT5 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SYPL2Q5VXT5 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SYPL2Q5VXT5 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SYPL2Q5VXT5 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SYPL2Q5VXT5 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SYPL2Q5VXT5 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SYPL2Q5VXT5 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SYPL2Q5VXT5 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SYPL2Q5VXT5 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SYPL2Q5VXT5 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SYPL2Q5VXT5 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SYPL2Q5VXT5 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SYPL2Q5VXT5 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
SYPL2Q5VXT5 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
SYPL2Q5VXT5 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
SYPL2Q5VXT5 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
SYPL2Q5VXT5 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
SYPL2Q5VXT5 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SYPL2Q5VXT5 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SYPL2Q5VXT5 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SYPL2Q5VXT5 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SYPL2Q5VXT5 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
SYPL2Q5VXT5 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
SYPL2Q5VXT5 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SYPL2Q5VXT5 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SYPL2Q5VXT5 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SYPL2Q5VXT5 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SYPL2Q5VXT5 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SYPL2Q5VXT5 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SYPL2Q5VXT5 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SYPL2Q5VXT5 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SYPL2Q5VXT5 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
SYPL2Q5VXT5 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SYPL2Q5VXT5 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
SYPL2Q5VXT5 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.95■■□□□ 1.75
SYPL2Q5VXT5 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SYPL2Q5VXT5 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SYPL2Q5VXT5 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SYPL2Q5VXT5 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SYPL2Q5VXT5 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SYPL2Q5VXT5 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.7 ms