Protein–RNA interactions for Protein: Q5TGU0

TSPO2, Translocator protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPO2Q5TGU0 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TSPO2Q5TGU0 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TSPO2Q5TGU0 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TSPO2Q5TGU0 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
TSPO2Q5TGU0 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TSPO2Q5TGU0 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TSPO2Q5TGU0 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TSPO2Q5TGU0 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TSPO2Q5TGU0 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TSPO2Q5TGU0 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TSPO2Q5TGU0 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TSPO2Q5TGU0 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TSPO2Q5TGU0 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TSPO2Q5TGU0 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TSPO2Q5TGU0 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TSPO2Q5TGU0 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TSPO2Q5TGU0 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TSPO2Q5TGU0 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TSPO2Q5TGU0 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TSPO2Q5TGU0 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TSPO2Q5TGU0 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TSPO2Q5TGU0 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TSPO2Q5TGU0 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TSPO2Q5TGU0 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TSPO2Q5TGU0 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TSPO2Q5TGU0 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TSPO2Q5TGU0 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TSPO2Q5TGU0 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TSPO2Q5TGU0 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TSPO2Q5TGU0 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TSPO2Q5TGU0 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TSPO2Q5TGU0 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TSPO2Q5TGU0 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TSPO2Q5TGU0 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TSPO2Q5TGU0 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TSPO2Q5TGU0 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TSPO2Q5TGU0 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TSPO2Q5TGU0 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TSPO2Q5TGU0 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TSPO2Q5TGU0 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TSPO2Q5TGU0 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TSPO2Q5TGU0 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TSPO2Q5TGU0 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TSPO2Q5TGU0 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TSPO2Q5TGU0 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TSPO2Q5TGU0 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TSPO2Q5TGU0 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TSPO2Q5TGU0 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TSPO2Q5TGU0 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TSPO2Q5TGU0 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TSPO2Q5TGU0 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TSPO2Q5TGU0 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TSPO2Q5TGU0 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TSPO2Q5TGU0 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TSPO2Q5TGU0 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TSPO2Q5TGU0 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TSPO2Q5TGU0 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TSPO2Q5TGU0 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TSPO2Q5TGU0 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TSPO2Q5TGU0 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TSPO2Q5TGU0 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TSPO2Q5TGU0 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TSPO2Q5TGU0 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TSPO2Q5TGU0 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TSPO2Q5TGU0 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TSPO2Q5TGU0 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TSPO2Q5TGU0 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TSPO2Q5TGU0 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TSPO2Q5TGU0 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TSPO2Q5TGU0 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
TSPO2Q5TGU0 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TSPO2Q5TGU0 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TSPO2Q5TGU0 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
TSPO2Q5TGU0 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TSPO2Q5TGU0 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TSPO2Q5TGU0 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TSPO2Q5TGU0 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TSPO2Q5TGU0 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TSPO2Q5TGU0 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TSPO2Q5TGU0 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TSPO2Q5TGU0 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TSPO2Q5TGU0 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TSPO2Q5TGU0 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TSPO2Q5TGU0 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TSPO2Q5TGU0 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TSPO2Q5TGU0 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TSPO2Q5TGU0 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TSPO2Q5TGU0 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TSPO2Q5TGU0 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
TSPO2Q5TGU0 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TSPO2Q5TGU0 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
TSPO2Q5TGU0 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TSPO2Q5TGU0 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TSPO2Q5TGU0 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
TSPO2Q5TGU0 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TSPO2Q5TGU0 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TSPO2Q5TGU0 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TSPO2Q5TGU0 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
TSPO2Q5TGU0 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TSPO2Q5TGU0 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.2 ms