Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHZ5

Lmod2, Leiomodin-2, mousemouse

Predictions only

Length 550 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmod2Q3UHZ5 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,2■■■■□ 3,23
Lmod2Q3UHZ5 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC35,2■■■■□ 3,23
Lmod2Q3UHZ5 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35,2■■■■□ 3,23
Lmod2Q3UHZ5 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35,2■■■■□ 3,23
Lmod2Q3UHZ5 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35,2■■■■□ 3,23
Lmod2Q3UHZ5 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,2■■■■□ 3,23
Lmod2Q3UHZ5 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,19■■■■□ 3,22
Lmod2Q3UHZ5 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC35,19■■■■□ 3,22
Lmod2Q3UHZ5 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,18■■■■□ 3,22
Lmod2Q3UHZ5 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,17■■■■□ 3,22
Lmod2Q3UHZ5 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35,16■■■■□ 3,22
Lmod2Q3UHZ5 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC35,15■■■■□ 3,22
Lmod2Q3UHZ5 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC35,15■■■■□ 3,22
Lmod2Q3UHZ5 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,14■■■■□ 3,22
Lmod2Q3UHZ5 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC35,14■■■■□ 3,22
Lmod2Q3UHZ5 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC35,13■■■■□ 3,22
Lmod2Q3UHZ5 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35,13■■■■□ 3,21
Lmod2Q3UHZ5 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35,13■■■■□ 3,21
Lmod2Q3UHZ5 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35,12■■■■□ 3,21
Lmod2Q3UHZ5 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,12■■■■□ 3,21
Lmod2Q3UHZ5 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC35,12■■■■□ 3,21
Lmod2Q3UHZ5 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC35,12■■■■□ 3,21
Lmod2Q3UHZ5 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,12■■■■□ 3,21
Lmod2Q3UHZ5 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,11■■■■□ 3,21
Lmod2Q3UHZ5 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC35,1■■■■□ 3,21
Lmod2Q3UHZ5 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35,09■■■■□ 3,21
Lmod2Q3UHZ5 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35,09■■■■□ 3,21
Lmod2Q3UHZ5 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC35,09■■■■□ 3,21
Lmod2Q3UHZ5 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,08■■■■□ 3,21
Lmod2Q3UHZ5 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,07■■■■□ 3,2
Lmod2Q3UHZ5 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,07■■■■□ 3,2
Lmod2Q3UHZ5 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC35,06■■■■□ 3,2
Lmod2Q3UHZ5 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC35,06■■■■□ 3,2
Lmod2Q3UHZ5 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC35,05■■■■□ 3,2
Lmod2Q3UHZ5 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,04■■■■□ 3,2
Lmod2Q3UHZ5 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,04■■■■□ 3,2
Lmod2Q3UHZ5 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35,03■■■■□ 3,2
Lmod2Q3UHZ5 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35,02■■■■□ 3,2
Lmod2Q3UHZ5 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC35,02■■■■□ 3,2
Lmod2Q3UHZ5 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC35,02■■■■□ 3,2
Lmod2Q3UHZ5 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC35,01■■■■□ 3,2
Lmod2Q3UHZ5 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC35,01■■■■□ 3,2
Lmod2Q3UHZ5 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35,01■■■■□ 3,19
Lmod2Q3UHZ5 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC35■■■■□ 3,19
Lmod2Q3UHZ5 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3,19
Lmod2Q3UHZ5 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3,19
Lmod2Q3UHZ5 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC34,99■■■■□ 3,19
Lmod2Q3UHZ5 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC34,99■■■■□ 3,19
Lmod2Q3UHZ5 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,99■■■■□ 3,19
Lmod2Q3UHZ5 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,99■■■■□ 3,19
Lmod2Q3UHZ5 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC34,98■■■■□ 3,19
Lmod2Q3UHZ5 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,97■■■■□ 3,19
Lmod2Q3UHZ5 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34,97■■■■□ 3,19
Lmod2Q3UHZ5 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,96■■■■□ 3,19
Lmod2Q3UHZ5 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,96■■■■□ 3,19
Lmod2Q3UHZ5 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34,96■■■■□ 3,19
Lmod2Q3UHZ5 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34,95■■■■□ 3,19
Lmod2Q3UHZ5 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC34,95■■■■□ 3,19
Lmod2Q3UHZ5 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,95■■■■□ 3,19
Lmod2Q3UHZ5 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC34,94■■■■□ 3,18
Lmod2Q3UHZ5 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,94■■■■□ 3,18
Lmod2Q3UHZ5 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34,94■■■■□ 3,18
Lmod2Q3UHZ5 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34,93■■■■□ 3,18
Lmod2Q3UHZ5 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC34,93■■■■□ 3,18
Lmod2Q3UHZ5 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC34,93■■■■□ 3,18
Lmod2Q3UHZ5 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34,91■■■■□ 3,18
Lmod2Q3UHZ5 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,91■■■■□ 3,18
Lmod2Q3UHZ5 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC34,91■■■■□ 3,18
Lmod2Q3UHZ5 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC34,9■■■■□ 3,18
Lmod2Q3UHZ5 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC34,9■■■■□ 3,18
Lmod2Q3UHZ5 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC34,9■■■■□ 3,18
Lmod2Q3UHZ5 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC34,9■■■■□ 3,18
Lmod2Q3UHZ5 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,9■■■■□ 3,18
Lmod2Q3UHZ5 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC34,9■■■■□ 3,18
Lmod2Q3UHZ5 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC34,89■■■■□ 3,18
Lmod2Q3UHZ5 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,87■■■■□ 3,17
Lmod2Q3UHZ5 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC34,87■■■■□ 3,17
Lmod2Q3UHZ5 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,87■■■■□ 3,17
Lmod2Q3UHZ5 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34,87■■■■□ 3,17
Lmod2Q3UHZ5 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC34,85■■■■□ 3,17
Lmod2Q3UHZ5 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC34,84■■■■□ 3,17
Lmod2Q3UHZ5 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC34,84■■■■□ 3,17
Lmod2Q3UHZ5 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34,84■■■■□ 3,17
Lmod2Q3UHZ5 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34,83■■■■□ 3,17
Lmod2Q3UHZ5 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC34,83■■■■□ 3,17
Lmod2Q3UHZ5 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,83■■■■□ 3,17
Lmod2Q3UHZ5 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC34,82■■■■□ 3,16
Lmod2Q3UHZ5 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34,82■■■■□ 3,16
Lmod2Q3UHZ5 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34,81■■■■□ 3,16
Lmod2Q3UHZ5 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC34,81■■■■□ 3,16
Lmod2Q3UHZ5 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC34,81■■■■□ 3,16
Lmod2Q3UHZ5 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,81■■■■□ 3,16
Lmod2Q3UHZ5 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC34,81■■■■□ 3,16
Lmod2Q3UHZ5 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC34,81■■■■□ 3,16
Lmod2Q3UHZ5 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34,81■■■■□ 3,16
Lmod2Q3UHZ5 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC34,81■■■■□ 3,16
Lmod2Q3UHZ5 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,8■■■■□ 3,16
Lmod2Q3UHZ5 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34,79■■■■□ 3,16
Lmod2Q3UHZ5 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC34,79■■■■□ 3,16
Lmod2Q3UHZ5 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC34,79■■■■□ 3,16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11,3 ms