Protein–RNA interactions for Protein: Q12460

NOP56, Nucleolar protein 56, yeastyeast

Known RBP RIP-Chip data

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
NOP56Q12460 YDR401WYDR401W 564 nt7.05□□□□□ -1.28
NOP56Q12460 AVO2YMR068W 1281 nt7.05□□□□□ -1.28
NOP56Q12460 YGR137WYGR137W 375 nt7.04□□□□□ -1.28
NOP56Q12460 REV7YIL139C 738 nt7.04□□□□□ -1.28
NOP56Q12460 TIF2YJL138C 1188 nt7.04□□□□□ -1.28
NOP56Q12460 TIF1YKR059W 1188 nt7.04□□□□□ -1.28
NOP56Q12460 RBS1YDL189W 1374 nt7.04□□□□□ -1.28
NOP56Q12460 MEP1YGR121C 1479 nt7.04□□□□□ -1.28
NOP56Q12460 HTS1YPR033C 1641 nt7.03□□□□□ -1.28
NOP56Q12460 YJL064WYJL064W 396 nt7.03□□□□□ -1.28
NOP56Q12460 AST1YBL069W 1290 nt7.03□□□□□ -1.28
NOP56Q12460 MET22YOL064C 1074 nt7.03□□□□□ -1.28
NOP56Q12460 SIR2YDL042C 1689 nt7.03□□□□□ -1.28
NOP56Q12460 PDC5YLR134W 1692 nt7.03□□□□□ -1.28
NOP56Q12460 POX1YGL205W 2247 nt7.03□□□□□ -1.28
NOP56Q12460 AVL9YLR114C 2295 nt7.02□□□□□ -1.29
NOP56Q12460 PEX28YHR150W 1740 nt7.02□□□□□ -1.29
NOP56Q12460 SER2YGR208W 930 nt7.02□□□□□ -1.29
NOP56Q12460 PAU19YMR325W 375 nt7.02□□□□□ -1.29
NOP56Q12460 MRP7YNL005C 1116 nt7.02□□□□□ -1.29
NOP56Q12460 ENP1YBR247C 1452 nt7.02□□□□□ -1.29
NOP56Q12460 YEL020CYEL020C 1683 nt7.01□□□□□ -1.29
NOP56Q12460 CTF8YHR191C 402 nt7.01□□□□□ -1.29
NOP56Q12460 RCF1YML030W 480 nt7.01□□□□□ -1.29
NOP56Q12460 YMR147WYMR147W 672 nt7.01□□□□□ -1.29
NOP56Q12460 YMR166CYMR166C 1107 nt7.01□□□□□ -1.29
NOP56Q12460 LDB19YOR322C 2457 nt7.01□□□□□ -1.29
NOP56Q12460 VHT1YGR065C 1782 nt7□□□□□ -1.29
NOP56Q12460 HXT17YNR072W 1695 nt7□□□□□ -1.29
NOP56Q12460 COS6YGR295C 1146 nt7□□□□□ -1.29
NOP56Q12460 OCH1YGL038C 1443 nt7□□□□□ -1.29 RIP-Chip
NOP56Q12460 YIL077CYIL077C 963 nt6.99□□□□□ -1.29 RIP-Chip
NOP56Q12460 YIR017W-AYIR017W-A 600 nt6.99□□□□□ -1.29
NOP56Q12460 NCA3YJL116C 1014 nt6.99□□□□□ -1.29
NOP56Q12460 AIM2YAL049C 741 nt6.99□□□□□ -1.29
NOP56Q12460 RNA170RNA170 169 nt6.99□□□□□ -1.29
NOP56Q12460 YOR012WYOR012W 414 nt6.99□□□□□ -1.29
NOP56Q12460 YPL071CYPL071C 471 nt6.99□□□□□ -1.29
NOP56Q12460 APM1YPL259C 1428 nt6.99□□□□□ -1.29
NOP56Q12460 ENB1YOL158C 1821 nt6.99□□□□□ -1.29
NOP56Q12460 KNS1YLL019C 2214 nt6.99□□□□□ -1.29 RIP-Chip
NOP56Q12460 RIO1YOR119C 1455 nt6.98□□□□□ -1.29 RIP-Chip
NOP56Q12460 EHT1YBR177C 1356 nt6.98□□□□□ -1.29
NOP56Q12460 SKI2YLR398C 3864 nt6.98□□□□□ -1.29
NOP56Q12460 DPB2YPR175W 2070 nt6.98□□□□□ -1.29
NOP56Q12460 YGR210CYGR210C 1236 nt6.98□□□□□ -1.29
NOP56Q12460 SRN2YLR119W 642 nt6.98□□□□□ -1.29
NOP56Q12460 OCA1YNL099C 717 nt6.98□□□□□ -1.29
NOP56Q12460 YHR140WYHR140W 720 nt6.97□□□□□ -1.29
NOP56Q12460 TES1YJR019C 1050 nt6.97□□□□□ -1.29
NOP56Q12460 DCR2YLR361C 1737 nt6.96□□□□□ -1.29
NOP56Q12460 CAK1YFL029C 1107 nt6.96□□□□□ -1.3
NOP56Q12460 RRT14YIL127C 621 nt6.96□□□□□ -1.3
NOP56Q12460 PUP3YER094C 618 nt6.95□□□□□ -1.3
NOP56Q12460 YPL108WYPL108W 507 nt6.95□□□□□ -1.3
NOP56Q12460 RHO1YPR165W 630 nt6.95□□□□□ -1.3
NOP56Q12460 YPT31YER031C 672 nt6.94□□□□□ -1.3
NOP56Q12460 KTR5YNL029C 1569 nt6.94□□□□□ -1.3
NOP56Q12460 DIP5YPL265W 1827 nt6.94□□□□□ -1.3 RIP-Chip
NOP56Q12460 FLC2YAL053W 2352 nt6.94□□□□□ -1.3 RIP-Chip
NOP56Q12460 RAP1YNL216W 2484 nt6.93□□□□□ -1.3
NOP56Q12460 YCR041WYCR041W 333 nt6.93□□□□□ -1.3
NOP56Q12460 ALG7YBR243C 1347 nt6.93□□□□□ -1.3
NOP56Q12460 SAC6YDR129C 1929 nt6.93□□□□□ -1.3
NOP56Q12460 ARP3YJR065C 1350 nt6.93□□□□□ -1.3
NOP56Q12460 SNF4YGL115W 969 nt6.92□□□□□ -1.3
NOP56Q12460 CDA1YLR307W 906 nt6.92□□□□□ -1.3
NOP56Q12460 LSP1YPL004C 1026 nt6.92□□□□□ -1.3
NOP56Q12460 HST2YPL015C 1074 nt6.92□□□□□ -1.3
NOP56Q12460 THI73YLR004C 1572 nt6.91□□□□□ -1.3
NOP56Q12460 CDC10YCR002C 969 nt6.91□□□□□ -1.3
NOP56Q12460 YHL030W-AYHL030W-A 462 nt6.91□□□□□ -1.3
NOP56Q12460 ISC1YER019W 1434 nt6.91□□□□□ -1.3
NOP56Q12460 PHO3YBR092C 1404 nt6.91□□□□□ -1.3
NOP56Q12460 YCP4YCR004C 744 nt6.9□□□□□ -1.3
NOP56Q12460 TGA1tA(UGC)A 73 nt6.9□□□□□ -1.3
NOP56Q12460 tA(UGC)EtA(UGC)E 73 nt6.9□□□□□ -1.3
NOP56Q12460 tA(UGC)GtA(UGC)G 73 nt6.9□□□□□ -1.3
NOP56Q12460 tA(UGC)LtA(UGC)L 73 nt6.9□□□□□ -1.3
NOP56Q12460 tA(UGC)OtA(UGC)O 73 nt6.9□□□□□ -1.3
NOP56Q12460 CWC25YNL245C 540 nt6.89□□□□□ -1.31
NOP56Q12460 TFC6YDR362C 2019 nt6.89□□□□□ -1.31
NOP56Q12460 YBL113CYBL113C 2379 nt6.89□□□□□ -1.31 RIP-Chip
NOP56Q12460 BDF2YDL070W 1917 nt6.88□□□□□ -1.31
NOP56Q12460 MSS51YLR203C 1311 nt6.88□□□□□ -1.31
NOP56Q12460 TRP1YDR007W 675 nt6.88□□□□□ -1.31
NOP56Q12460 YJL043WYJL043W 774 nt6.88□□□□□ -1.31
NOP56Q12460 PMU1YKL128C 888 nt6.88□□□□□ -1.31
NOP56Q12460 SNF7YLR025W 723 nt6.88□□□□□ -1.31
NOP56Q12460 TAF11YML015C 1041 nt6.88□□□□□ -1.31
NOP56Q12460 PRE10YOR362C 867 nt6.88□□□□□ -1.31
NOP56Q12460 RTC2YBR147W 891 nt6.88□□□□□ -1.31
NOP56Q12460 SKN1YGR143W 2316 nt6.88□□□□□ -1.31
NOP56Q12460 CHS5YLR330W 2016 nt6.88□□□□□ -1.31
NOP56Q12460 ECM38YLR299W 1983 nt6.88□□□□□ -1.31
NOP56Q12460 OPT1YJL212C 2400 nt6.87□□□□□ -1.31
NOP56Q12460 LEO1YOR123C 1395 nt6.87□□□□□ -1.31
NOP56Q12460 SUB2YDL084W 1341 nt6.87□□□□□ -1.31
NOP56Q12460 QNS1YHR074W 2145 nt6.87□□□□□ -1.31
NOP56Q12460 ERP5YHR110W 639 nt6.87□□□□□ -1.31
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 101.3 ms