Protein–RNA interactions for Protein: Q0GA42

Cnnm1, Metal transporter CNNM1, mousemouse

Predictions only

Length 951 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnnm1Q0GA42 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Cnnm1Q0GA42 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Cnnm1Q0GA42 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Cnnm1Q0GA42 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Cnnm1Q0GA42 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Cnnm1Q0GA42 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Cnnm1Q0GA42 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Cnnm1Q0GA42 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
Cnnm1Q0GA42 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Cnnm1Q0GA42 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Cnnm1Q0GA42 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
Cnnm1Q0GA42 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Cnnm1Q0GA42 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Cnnm1Q0GA42 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Cnnm1Q0GA42 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
Cnnm1Q0GA42 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Cnnm1Q0GA42 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Cnnm1Q0GA42 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Cnnm1Q0GA42 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Cnnm1Q0GA42 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Cnnm1Q0GA42 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Cnnm1Q0GA42 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Cnnm1Q0GA42 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Cnnm1Q0GA42 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Cnnm1Q0GA42 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Cnnm1Q0GA42 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Cnnm1Q0GA42 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Cnnm1Q0GA42 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Cnnm1Q0GA42 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Cnnm1Q0GA42 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Cnnm1Q0GA42 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Cnnm1Q0GA42 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Cnnm1Q0GA42 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Cnnm1Q0GA42 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Cnnm1Q0GA42 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
Cnnm1Q0GA42 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Cnnm1Q0GA42 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Cnnm1Q0GA42 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
Cnnm1Q0GA42 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Cnnm1Q0GA42 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Cnnm1Q0GA42 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Cnnm1Q0GA42 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Cnnm1Q0GA42 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Cnnm1Q0GA42 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Cnnm1Q0GA42 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Cnnm1Q0GA42 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Cnnm1Q0GA42 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Cnnm1Q0GA42 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Cnnm1Q0GA42 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Cnnm1Q0GA42 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Cnnm1Q0GA42 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Cnnm1Q0GA42 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Cnnm1Q0GA42 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Cnnm1Q0GA42 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Cnnm1Q0GA42 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Cnnm1Q0GA42 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
Cnnm1Q0GA42 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
Cnnm1Q0GA42 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Cnnm1Q0GA42 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Cnnm1Q0GA42 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Cnnm1Q0GA42 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Cnnm1Q0GA42 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Cnnm1Q0GA42 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Cnnm1Q0GA42 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
Cnnm1Q0GA42 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Cnnm1Q0GA42 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Cnnm1Q0GA42 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Cnnm1Q0GA42 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Cnnm1Q0GA42 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Cnnm1Q0GA42 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Cnnm1Q0GA42 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Cnnm1Q0GA42 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Cnnm1Q0GA42 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Cnnm1Q0GA42 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Cnnm1Q0GA42 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Cnnm1Q0GA42 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
Cnnm1Q0GA42 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Cnnm1Q0GA42 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
Cnnm1Q0GA42 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Cnnm1Q0GA42 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Cnnm1Q0GA42 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Cnnm1Q0GA42 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Cnnm1Q0GA42 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Cnnm1Q0GA42 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Cnnm1Q0GA42 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Cnnm1Q0GA42 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Cnnm1Q0GA42 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Cnnm1Q0GA42 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Cnnm1Q0GA42 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Cnnm1Q0GA42 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Cnnm1Q0GA42 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Cnnm1Q0GA42 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Cnnm1Q0GA42 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Cnnm1Q0GA42 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Cnnm1Q0GA42 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Cnnm1Q0GA42 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Cnnm1Q0GA42 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Cnnm1Q0GA42 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
Cnnm1Q0GA42 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Cnnm1Q0GA42 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 534.9 ms