Protein–RNA interactions for Protein: Q07343

PDE4B, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4B, humanhuman

Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4BQ07343 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
PDE4BQ07343 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
PDE4BQ07343 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
PDE4BQ07343 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
PDE4BQ07343 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
PDE4BQ07343 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
PDE4BQ07343 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
PDE4BQ07343 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
PDE4BQ07343 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC29.64■■■□□ 2.34
PDE4BQ07343 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
PDE4BQ07343 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
PDE4BQ07343 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
PDE4BQ07343 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC29.63■■■□□ 2.33
PDE4BQ07343 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
PDE4BQ07343 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
PDE4BQ07343 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
PDE4BQ07343 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
PDE4BQ07343 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
PDE4BQ07343 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
PDE4BQ07343 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
PDE4BQ07343 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC29.61■■■□□ 2.33
PDE4BQ07343 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
PDE4BQ07343 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
PDE4BQ07343 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
PDE4BQ07343 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
PDE4BQ07343 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
PDE4BQ07343 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
PDE4BQ07343 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
PDE4BQ07343 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
PDE4BQ07343 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
PDE4BQ07343 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
PDE4BQ07343 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
PDE4BQ07343 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
PDE4BQ07343 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
PDE4BQ07343 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
PDE4BQ07343 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
PDE4BQ07343 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
PDE4BQ07343 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
PDE4BQ07343 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC29.56■■■□□ 2.32
PDE4BQ07343 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
PDE4BQ07343 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
PDE4BQ07343 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
PDE4BQ07343 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
PDE4BQ07343 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
PDE4BQ07343 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.54■■■□□ 2.32
PDE4BQ07343 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
PDE4BQ07343 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
PDE4BQ07343 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
PDE4BQ07343 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
PDE4BQ07343 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
PDE4BQ07343 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
PDE4BQ07343 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
PDE4BQ07343 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
PDE4BQ07343 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
PDE4BQ07343 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
PDE4BQ07343 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
PDE4BQ07343 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
PDE4BQ07343 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
PDE4BQ07343 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
PDE4BQ07343 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
PDE4BQ07343 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
PDE4BQ07343 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
PDE4BQ07343 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
PDE4BQ07343 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
PDE4BQ07343 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC29.45■■■□□ 2.31
PDE4BQ07343 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
PDE4BQ07343 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
PDE4BQ07343 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
PDE4BQ07343 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
PDE4BQ07343 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
PDE4BQ07343 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
PDE4BQ07343 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
PDE4BQ07343 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
PDE4BQ07343 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
PDE4BQ07343 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
PDE4BQ07343 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
PDE4BQ07343 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
PDE4BQ07343 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC29.41■■■□□ 2.3
PDE4BQ07343 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
PDE4BQ07343 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
PDE4BQ07343 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
PDE4BQ07343 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
PDE4BQ07343 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
PDE4BQ07343 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
PDE4BQ07343 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
PDE4BQ07343 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
PDE4BQ07343 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
PDE4BQ07343 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
PDE4BQ07343 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
PDE4BQ07343 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
PDE4BQ07343 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
PDE4BQ07343 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
PDE4BQ07343 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
PDE4BQ07343 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
PDE4BQ07343 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
PDE4BQ07343 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
PDE4BQ07343 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
PDE4BQ07343 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
PDE4BQ07343 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
PDE4BQ07343 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms