Protein–RNA interactions for Protein: Q05541

NSE3, Non-structural maintenance of chromosome element 3, yeastyeast

Predictions only

Length 303 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
NSE3Q05541 YNL067W-AYNL067W-A 147 nt8.83□□□□□ -1
NSE3Q05541 RUP1YOR138C 2016 nt8.83□□□□□ -1
NSE3Q05541 HXK1YFR053C 1458 nt8.83□□□□□ -1
NSE3Q05541 YDR327WYDR327W 327 nt8.82□□□□□ -1
NSE3Q05541 MDH2YOL126C 1134 nt8.82□□□□□ -1
NSE3Q05541 AFG3YER017C 2286 nt8.82□□□□□ -1
NSE3Q05541 YJL045WYJL045W 1905 nt8.82□□□□□ -1
NSE3Q05541 PLB2YMR006C 2121 nt8.81□□□□□ -1
NSE3Q05541 TPI1YDR050C 747 nt8.81□□□□□ -1
NSE3Q05541 YJL211CYJL211C 444 nt8.81□□□□□ -1
NSE3Q05541 YOL046CYOL046C 675 nt8.81□□□□□ -1
NSE3Q05541 YJL163CYJL163C 1668 nt8.8□□□□□ -1
NSE3Q05541 TOP3YLR234W 1971 nt8.8□□□□□ -1
NSE3Q05541 UBP13YBL067C 2244 nt8.79□□□□□ -1
NSE3Q05541 SUF3tG(CCC)D 72 nt8.79□□□□□ -1
NSE3Q05541 YNR001W-AYNR001W-A 219 nt8.79□□□□□ -1
NSE3Q05541 YPR076WYPR076W 375 nt8.79□□□□□ -1
NSE3Q05541 HNM1YGL077C 1692 nt8.78□□□□□ -1
NSE3Q05541 MAK32YCR019W 1092 nt8.78□□□□□ -1
NSE3Q05541 HTZ1YOL012C 405 nt8.78□□□□□ -1
NSE3Q05541 FCY22YER060W-A 1593 nt8.78□□□□□ -1
NSE3Q05541 SGF73YGL066W 1974 nt8.77□□□□□ -1
NSE3Q05541 YEL034C-AYEL034C-A 603 nt8.77□□□□□ -1.01
NSE3Q05541 DUS3YLR401C 2007 nt8.76□□□□□ -1.01
NSE3Q05541 HOC1YJR075W 1191 nt8.76□□□□□ -1.01
NSE3Q05541 YBL113CYBL113C 2379 nt8.76□□□□□ -1.01
NSE3Q05541 EEB1YPL095C 1371 nt8.74□□□□□ -1.01
NSE3Q05541 PMT7YDR307W 1989 nt8.74□□□□□ -1.01
NSE3Q05541 LIA1YJR070C 978 nt8.74□□□□□ -1.01
NSE3Q05541 YMR074CYMR074C 438 nt8.74□□□□□ -1.01
NSE3Q05541 YNR005CYNR005C 405 nt8.74□□□□□ -1.01
NSE3Q05541 YEL023CYEL023C 2049 nt8.74□□□□□ -1.01
NSE3Q05541 COX15YER141W 1461 nt8.74□□□□□ -1.01
NSE3Q05541 RDR1YOR380W 1641 nt8.73□□□□□ -1.01
NSE3Q05541 BRN1YBL097W 2265 nt8.73□□□□□ -1.01
NSE3Q05541 GPD1YDL022W 1176 nt8.73□□□□□ -1.01
NSE3Q05541 DMC1YER179W 1005 nt8.73□□□□□ -1.01
NSE3Q05541 FIT2YOR382W 462 nt8.73□□□□□ -1.01
NSE3Q05541 REG2YBR050C 1017 nt8.73□□□□□ -1.01
NSE3Q05541 AGX1YFL030W 1158 nt8.72□□□□□ -1.01
NSE3Q05541 YHM2YMR241W 945 nt8.72□□□□□ -1.01
NSE3Q05541 TCB1YOR086C 3561 nt8.72□□□□□ -1.01
NSE3Q05541 APE4YHR113W 1473 nt8.71□□□□□ -1.01
NSE3Q05541 PPH21YDL134C 1110 nt8.71□□□□□ -1.02
NSE3Q05541 SWP1YMR149W 861 nt8.71□□□□□ -1.02
NSE3Q05541 RPL43AYPR043W 279 nt8.71□□□□□ -1.02
NSE3Q05541 RTG2YGL252C 1767 nt8.7□□□□□ -1.02
NSE3Q05541 CDC7YDL017W 1524 nt8.7□□□□□ -1.02
NSE3Q05541 MRPL35YDR322W 1104 nt8.69□□□□□ -1.02
NSE3Q05541 YGL260WYGL260W 231 nt8.69□□□□□ -1.02
NSE3Q05541 POR2YIL114C 846 nt8.69□□□□□ -1.02
NSE3Q05541 SUN4YNL066W 1263 nt8.69□□□□□ -1.02
NSE3Q05541 PFS2YNL317W 1398 nt8.69□□□□□ -1.02
NSE3Q05541 SSC1YJR045C 1965 nt8.68□□□□□ -1.02
NSE3Q05541 PMP3YDR276C 168 nt8.68□□□□□ -1.02
NSE3Q05541 YKL147CYKL147C 618 nt8.68□□□□□ -1.02
NSE3Q05541 HSV2YGR223C 1347 nt8.67□□□□□ -1.02
NSE3Q05541 ERG27YLR100W 1044 nt8.67□□□□□ -1.02
NSE3Q05541 PGI1YBR196C 1665 nt8.66□□□□□ -1.02
NSE3Q05541 YOL099CYOL099C 492 nt8.66□□□□□ -1.02
NSE3Q05541 ASR1YPR093C 867 nt8.65□□□□□ -1.02
NSE3Q05541 SGV1YPR161C 1974 nt8.64□□□□□ -1.03
NSE3Q05541 GNA1YFL017C 480 nt8.64□□□□□ -1.03
NSE3Q05541 AIM20YIL158W 615 nt8.64□□□□□ -1.03
NSE3Q05541 LIP5YOR196C 1245 nt8.64□□□□□ -1.03
NSE3Q05541 TOM71YHR117W 1920 nt8.63□□□□□ -1.03
NSE3Q05541 NTG2YOL043C 1143 nt8.63□□□□□ -1.03
NSE3Q05541 YRF1-1YDR545W 5391 nt8.63□□□□□ -1.03
NSE3Q05541 YRF1-5YLR467W 5391 nt8.63□□□□□ -1.03
NSE3Q05541 YRF1-8YOR396W 5391 nt8.63□□□□□ -1.03
NSE3Q05541 FMP40YPL222W 2067 nt8.63□□□□□ -1.03
NSE3Q05541 SNU71YGR013W 1863 nt8.62□□□□□ -1.03
NSE3Q05541 MAM3YOL060C 2121 nt8.62□□□□□ -1.03
NSE3Q05541 GCD11YER025W 1584 nt8.61□□□□□ -1.03
NSE3Q05541 YCR049CYCR049C 447 nt8.61□□□□□ -1.03
NSE3Q05541 GAL83YER027C 1254 nt8.61□□□□□ -1.03
NSE3Q05541 MSS51YLR203C 1311 nt8.6□□□□□ -1.03
NSE3Q05541 OPI7YDR360W 435 nt8.6□□□□□ -1.03
NSE3Q05541 YOR041CYOR041C 432 nt8.6□□□□□ -1.03
NSE3Q05541 YPL136WYPL136W 369 nt8.59□□□□□ -1.03
NSE3Q05541 PZF1YPR186C 1290 nt8.59□□□□□ -1.03
NSE3Q05541 EHD3YDR036C 1503 nt8.59□□□□□ -1.03
NSE3Q05541 RPL2BYIL018W 765 nt8.58□□□□□ -1.04
NSE3Q05541 YLR030WYLR030W 792 nt8.58□□□□□ -1.04
NSE3Q05541 LCL3YGL085W 825 nt8.57□□□□□ -1.04
NSE3Q05541 GTS1YGL181W 1191 nt8.57□□□□□ -1.04
NSE3Q05541 YIL029W-AYIL029W-A 372 nt8.57□□□□□ -1.04
NSE3Q05541 CRH1YGR189C 1524 nt8.56□□□□□ -1.04
NSE3Q05541 STF1YDL130W-A 261 nt8.56□□□□□ -1.04
NSE3Q05541 YAL045CYAL045C 309 nt8.56□□□□□ -1.04
NSE3Q05541 YLL056CYLL056C 897 nt8.56□□□□□ -1.04
NSE3Q05541 YPL264CYPL264C 1062 nt8.56□□□□□ -1.04
NSE3Q05541 MAL31YBR298C 1845 nt8.56□□□□□ -1.04
NSE3Q05541 NUP49YGL172W 1419 nt8.55□□□□□ -1.04
NSE3Q05541 IMG1YCR046C 510 nt8.55□□□□□ -1.04
NSE3Q05541 YGL102CYGL102C 429 nt8.55□□□□□ -1.04
NSE3Q05541 SPG1YGR236C 288 nt8.55□□□□□ -1.04
NSE3Q05541 YKL153WYKL153W 510 nt8.55□□□□□ -1.04
NSE3Q05541 YLR184WYLR184W 348 nt8.55□□□□□ -1.04
NSE3Q05541 SCS22YBL091C-A 528 nt8.55□□□□□ -1.04
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 52.6 ms