Protein–RNA interactions for Protein: Q03938

ZNF90, Zinc finger protein 90, humanhuman

Predictions only

Length 601 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF90Q03938 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC19.67■□□□□ 0.74
ZNF90Q03938 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC19.67■□□□□ 0.74
ZNF90Q03938 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
ZNF90Q03938 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
ZNF90Q03938 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
ZNF90Q03938 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
ZNF90Q03938 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
ZNF90Q03938 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
ZNF90Q03938 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
ZNF90Q03938 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
ZNF90Q03938 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
ZNF90Q03938 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
ZNF90Q03938 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
ZNF90Q03938 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
ZNF90Q03938 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
ZNF90Q03938 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
ZNF90Q03938 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
ZNF90Q03938 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
ZNF90Q03938 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
ZNF90Q03938 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
ZNF90Q03938 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
ZNF90Q03938 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ZNF90Q03938 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ZNF90Q03938 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
ZNF90Q03938 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ZNF90Q03938 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ZNF90Q03938 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ZNF90Q03938 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ZNF90Q03938 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
ZNF90Q03938 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
ZNF90Q03938 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ZNF90Q03938 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
ZNF90Q03938 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
ZNF90Q03938 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ZNF90Q03938 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ZNF90Q03938 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
ZNF90Q03938 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
ZNF90Q03938 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
ZNF90Q03938 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ZNF90Q03938 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
ZNF90Q03938 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ZNF90Q03938 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ZNF90Q03938 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ZNF90Q03938 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ZNF90Q03938 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ZNF90Q03938 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ZNF90Q03938 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ZNF90Q03938 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ZNF90Q03938 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ZNF90Q03938 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ZNF90Q03938 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ZNF90Q03938 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ZNF90Q03938 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ZNF90Q03938 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
ZNF90Q03938 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ZNF90Q03938 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ZNF90Q03938 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ZNF90Q03938 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ZNF90Q03938 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ZNF90Q03938 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ZNF90Q03938 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ZNF90Q03938 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ZNF90Q03938 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ZNF90Q03938 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ZNF90Q03938 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ZNF90Q03938 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ZNF90Q03938 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ZNF90Q03938 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ZNF90Q03938 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ZNF90Q03938 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ZNF90Q03938 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ZNF90Q03938 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
ZNF90Q03938 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ZNF90Q03938 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ZNF90Q03938 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ZNF90Q03938 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ZNF90Q03938 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ZNF90Q03938 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ZNF90Q03938 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ZNF90Q03938 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ZNF90Q03938 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ZNF90Q03938 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
ZNF90Q03938 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ZNF90Q03938 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
ZNF90Q03938 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ZNF90Q03938 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ZNF90Q03938 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ZNF90Q03938 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ZNF90Q03938 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ZNF90Q03938 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ZNF90Q03938 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ZNF90Q03938 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
ZNF90Q03938 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ZNF90Q03938 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ZNF90Q03938 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ZNF90Q03938 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ZNF90Q03938 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ZNF90Q03938 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ZNF90Q03938 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ZNF90Q03938 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.5 ms