Protein–RNA interactions for Protein: Q03169

TNFAIP2, Tumor necrosis factor alpha-induced protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 654 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFAIP2Q03169 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
TNFAIP2Q03169 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
TNFAIP2Q03169 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
TNFAIP2Q03169 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
TNFAIP2Q03169 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
TNFAIP2Q03169 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
TNFAIP2Q03169 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
TNFAIP2Q03169 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
TNFAIP2Q03169 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
TNFAIP2Q03169 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
TNFAIP2Q03169 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
TNFAIP2Q03169 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
TNFAIP2Q03169 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
TNFAIP2Q03169 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
TNFAIP2Q03169 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
TNFAIP2Q03169 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
TNFAIP2Q03169 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
TNFAIP2Q03169 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
TNFAIP2Q03169 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
TNFAIP2Q03169 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
TNFAIP2Q03169 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
TNFAIP2Q03169 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC28.22■■■□□ 2.11
TNFAIP2Q03169 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
TNFAIP2Q03169 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
TNFAIP2Q03169 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
TNFAIP2Q03169 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
TNFAIP2Q03169 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
TNFAIP2Q03169 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
TNFAIP2Q03169 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
TNFAIP2Q03169 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
TNFAIP2Q03169 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
TNFAIP2Q03169 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
TNFAIP2Q03169 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
TNFAIP2Q03169 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
TNFAIP2Q03169 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
TNFAIP2Q03169 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
TNFAIP2Q03169 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
TNFAIP2Q03169 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
TNFAIP2Q03169 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
TNFAIP2Q03169 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
TNFAIP2Q03169 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
TNFAIP2Q03169 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC28.19■■■□□ 2.1
TNFAIP2Q03169 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC28.19■■■□□ 2.1
TNFAIP2Q03169 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TNFAIP2Q03169 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
TNFAIP2Q03169 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
TNFAIP2Q03169 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
TNFAIP2Q03169 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
TNFAIP2Q03169 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
TNFAIP2Q03169 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
TNFAIP2Q03169 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
TNFAIP2Q03169 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
TNFAIP2Q03169 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
TNFAIP2Q03169 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
TNFAIP2Q03169 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
TNFAIP2Q03169 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
TNFAIP2Q03169 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
TNFAIP2Q03169 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
TNFAIP2Q03169 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
TNFAIP2Q03169 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
TNFAIP2Q03169 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
TNFAIP2Q03169 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.09
TNFAIP2Q03169 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TNFAIP2Q03169 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC28.13■■■□□ 2.09
TNFAIP2Q03169 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TNFAIP2Q03169 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
TNFAIP2Q03169 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TNFAIP2Q03169 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
TNFAIP2Q03169 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
TNFAIP2Q03169 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
TNFAIP2Q03169 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
TNFAIP2Q03169 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
TNFAIP2Q03169 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
TNFAIP2Q03169 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
TNFAIP2Q03169 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
TNFAIP2Q03169 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
TNFAIP2Q03169 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
TNFAIP2Q03169 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
TNFAIP2Q03169 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
TNFAIP2Q03169 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
TNFAIP2Q03169 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
TNFAIP2Q03169 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
TNFAIP2Q03169 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TNFAIP2Q03169 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TNFAIP2Q03169 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
TNFAIP2Q03169 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
TNFAIP2Q03169 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TNFAIP2Q03169 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TNFAIP2Q03169 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
TNFAIP2Q03169 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
TNFAIP2Q03169 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC28.06■■■□□ 2.08
TNFAIP2Q03169 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
TNFAIP2Q03169 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
TNFAIP2Q03169 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC28.06■■■□□ 2.08
TNFAIP2Q03169 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
TNFAIP2Q03169 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TNFAIP2Q03169 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
TNFAIP2Q03169 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
TNFAIP2Q03169 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
TNFAIP2Q03169 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms