Protein–RNA interactions for Protein: Q00059

TFAM, Transcription factor A, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFAMQ00059 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TFAMQ00059 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
TFAMQ00059 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TFAMQ00059 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TFAMQ00059 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TFAMQ00059 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TFAMQ00059 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
TFAMQ00059 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TFAMQ00059 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TFAMQ00059 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
TFAMQ00059 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TFAMQ00059 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TFAMQ00059 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TFAMQ00059 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TFAMQ00059 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
TFAMQ00059 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TFAMQ00059 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
TFAMQ00059 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TFAMQ00059 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TFAMQ00059 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TFAMQ00059 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TFAMQ00059 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TFAMQ00059 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TFAMQ00059 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TFAMQ00059 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TFAMQ00059 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
TFAMQ00059 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TFAMQ00059 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TFAMQ00059 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
TFAMQ00059 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TFAMQ00059 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TFAMQ00059 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TFAMQ00059 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TFAMQ00059 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TFAMQ00059 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TFAMQ00059 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TFAMQ00059 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TFAMQ00059 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
TFAMQ00059 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TFAMQ00059 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TFAMQ00059 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TFAMQ00059 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
TFAMQ00059 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
TFAMQ00059 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
TFAMQ00059 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TFAMQ00059 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
TFAMQ00059 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TFAMQ00059 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TFAMQ00059 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TFAMQ00059 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TFAMQ00059 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TFAMQ00059 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TFAMQ00059 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TFAMQ00059 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TFAMQ00059 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
TFAMQ00059 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
TFAMQ00059 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TFAMQ00059 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
TFAMQ00059 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
TFAMQ00059 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TFAMQ00059 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
TFAMQ00059 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
TFAMQ00059 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TFAMQ00059 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
TFAMQ00059 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
TFAMQ00059 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
TFAMQ00059 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
TFAMQ00059 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
TFAMQ00059 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TFAMQ00059 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TFAMQ00059 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TFAMQ00059 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
TFAMQ00059 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TFAMQ00059 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TFAMQ00059 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TFAMQ00059 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TFAMQ00059 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TFAMQ00059 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TFAMQ00059 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
TFAMQ00059 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TFAMQ00059 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TFAMQ00059 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TFAMQ00059 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TFAMQ00059 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TFAMQ00059 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TFAMQ00059 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
TFAMQ00059 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
TFAMQ00059 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
TFAMQ00059 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
TFAMQ00059 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TFAMQ00059 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
TFAMQ00059 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
TFAMQ00059 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TFAMQ00059 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TFAMQ00059 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
TFAMQ00059 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TFAMQ00059 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TFAMQ00059 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TFAMQ00059 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TFAMQ00059 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.7 ms