Protein–RNA interactions for Protein: P82980

RBP5, Retinol-binding protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBP5P82980 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
RBP5P82980 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
RBP5P82980 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
RBP5P82980 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
RBP5P82980 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC26.91■■□□□ 1.9
RBP5P82980 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
RBP5P82980 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
RBP5P82980 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
RBP5P82980 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
RBP5P82980 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
RBP5P82980 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
RBP5P82980 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
RBP5P82980 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
RBP5P82980 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
RBP5P82980 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
RBP5P82980 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
RBP5P82980 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
RBP5P82980 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
RBP5P82980 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.9
RBP5P82980 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
RBP5P82980 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
RBP5P82980 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
RBP5P82980 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
RBP5P82980 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
RBP5P82980 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
RBP5P82980 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
RBP5P82980 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
RBP5P82980 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
RBP5P82980 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
RBP5P82980 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
RBP5P82980 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
RBP5P82980 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
RBP5P82980 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
RBP5P82980 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
RBP5P82980 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
RBP5P82980 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
RBP5P82980 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
RBP5P82980 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
RBP5P82980 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
RBP5P82980 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
RBP5P82980 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
RBP5P82980 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
RBP5P82980 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
RBP5P82980 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
RBP5P82980 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
RBP5P82980 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
RBP5P82980 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
RBP5P82980 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
RBP5P82980 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
RBP5P82980 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
RBP5P82980 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
RBP5P82980 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
RBP5P82980 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
RBP5P82980 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
RBP5P82980 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
RBP5P82980 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
RBP5P82980 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
RBP5P82980 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
RBP5P82980 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
RBP5P82980 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
RBP5P82980 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
RBP5P82980 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
RBP5P82980 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
RBP5P82980 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
RBP5P82980 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
RBP5P82980 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
RBP5P82980 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
RBP5P82980 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
RBP5P82980 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
RBP5P82980 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
RBP5P82980 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
RBP5P82980 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
RBP5P82980 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
RBP5P82980 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
RBP5P82980 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
RBP5P82980 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
RBP5P82980 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
RBP5P82980 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
RBP5P82980 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
RBP5P82980 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RBP5P82980 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
RBP5P82980 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
RBP5P82980 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
RBP5P82980 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
RBP5P82980 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
RBP5P82980 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
RBP5P82980 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
RBP5P82980 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
RBP5P82980 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
RBP5P82980 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
RBP5P82980 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
RBP5P82980 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
RBP5P82980 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
RBP5P82980 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
RBP5P82980 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
RBP5P82980 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
RBP5P82980 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
RBP5P82980 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
RBP5P82980 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
RBP5P82980 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms