Protein–RNA interactions for Protein: P54289

CACNA2D1, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D1P54289 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
CACNA2D1P54289 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CACNA2D1P54289 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CACNA2D1P54289 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CACNA2D1P54289 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CACNA2D1P54289 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CACNA2D1P54289 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CACNA2D1P54289 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
CACNA2D1P54289 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CACNA2D1P54289 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CACNA2D1P54289 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CACNA2D1P54289 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CACNA2D1P54289 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CACNA2D1P54289 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CACNA2D1P54289 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CACNA2D1P54289 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CACNA2D1P54289 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CACNA2D1P54289 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CACNA2D1P54289 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CACNA2D1P54289 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CACNA2D1P54289 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CACNA2D1P54289 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CACNA2D1P54289 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CACNA2D1P54289 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CACNA2D1P54289 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CACNA2D1P54289 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CACNA2D1P54289 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CACNA2D1P54289 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CACNA2D1P54289 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CACNA2D1P54289 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CACNA2D1P54289 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CACNA2D1P54289 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CACNA2D1P54289 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CACNA2D1P54289 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CACNA2D1P54289 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CACNA2D1P54289 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CACNA2D1P54289 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CACNA2D1P54289 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CACNA2D1P54289 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CACNA2D1P54289 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CACNA2D1P54289 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CACNA2D1P54289 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CACNA2D1P54289 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
CACNA2D1P54289 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CACNA2D1P54289 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
CACNA2D1P54289 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CACNA2D1P54289 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CACNA2D1P54289 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CACNA2D1P54289 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CACNA2D1P54289 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CACNA2D1P54289 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CACNA2D1P54289 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CACNA2D1P54289 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CACNA2D1P54289 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CACNA2D1P54289 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CACNA2D1P54289 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CACNA2D1P54289 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
CACNA2D1P54289 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
CACNA2D1P54289 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
CACNA2D1P54289 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CACNA2D1P54289 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CACNA2D1P54289 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CACNA2D1P54289 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CACNA2D1P54289 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CACNA2D1P54289 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CACNA2D1P54289 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CACNA2D1P54289 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CACNA2D1P54289 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CACNA2D1P54289 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CACNA2D1P54289 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CACNA2D1P54289 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CACNA2D1P54289 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CACNA2D1P54289 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CACNA2D1P54289 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CACNA2D1P54289 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CACNA2D1P54289 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CACNA2D1P54289 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CACNA2D1P54289 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
CACNA2D1P54289 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CACNA2D1P54289 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CACNA2D1P54289 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CACNA2D1P54289 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
CACNA2D1P54289 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CACNA2D1P54289 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CACNA2D1P54289 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CACNA2D1P54289 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CACNA2D1P54289 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CACNA2D1P54289 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CACNA2D1P54289 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CACNA2D1P54289 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CACNA2D1P54289 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CACNA2D1P54289 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CACNA2D1P54289 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CACNA2D1P54289 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CACNA2D1P54289 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CACNA2D1P54289 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CACNA2D1P54289 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CACNA2D1P54289 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
CACNA2D1P54289 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CACNA2D1P54289 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms