Protein–RNA interactions for Protein: P53814

SMTN, Smoothelin, humanhuman

Predictions only

Length 917 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMTNP53814 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
SMTNP53814 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SMTNP53814 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SMTNP53814 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SMTNP53814 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SMTNP53814 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SMTNP53814 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SMTNP53814 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SMTNP53814 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SMTNP53814 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SMTNP53814 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SMTNP53814 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SMTNP53814 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SMTNP53814 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SMTNP53814 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SMTNP53814 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SMTNP53814 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SMTNP53814 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SMTNP53814 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SMTNP53814 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SMTNP53814 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SMTNP53814 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SMTNP53814 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SMTNP53814 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SMTNP53814 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SMTNP53814 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SMTNP53814 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SMTNP53814 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
SMTNP53814 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
SMTNP53814 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
SMTNP53814 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
SMTNP53814 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
SMTNP53814 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SMTNP53814 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
SMTNP53814 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SMTNP53814 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SMTNP53814 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
SMTNP53814 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
SMTNP53814 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SMTNP53814 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
SMTNP53814 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SMTNP53814 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SMTNP53814 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
SMTNP53814 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SMTNP53814 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
SMTNP53814 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SMTNP53814 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
SMTNP53814 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
SMTNP53814 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SMTNP53814 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SMTNP53814 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
SMTNP53814 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SMTNP53814 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SMTNP53814 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SMTNP53814 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SMTNP53814 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SMTNP53814 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SMTNP53814 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SMTNP53814 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SMTNP53814 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SMTNP53814 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SMTNP53814 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SMTNP53814 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SMTNP53814 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SMTNP53814 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SMTNP53814 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SMTNP53814 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SMTNP53814 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SMTNP53814 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SMTNP53814 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SMTNP53814 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SMTNP53814 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SMTNP53814 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SMTNP53814 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
SMTNP53814 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
SMTNP53814 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.99
SMTNP53814 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
SMTNP53814 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SMTNP53814 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SMTNP53814 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SMTNP53814 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SMTNP53814 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
SMTNP53814 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
SMTNP53814 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
SMTNP53814 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SMTNP53814 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SMTNP53814 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SMTNP53814 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SMTNP53814 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SMTNP53814 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
SMTNP53814 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SMTNP53814 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SMTNP53814 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SMTNP53814 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SMTNP53814 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SMTNP53814 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SMTNP53814 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SMTNP53814 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SMTNP53814 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SMTNP53814 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.3 ms