Protein–RNA interactions for Protein: P52797

EFNA3, Ephrin-A3, humanhuman

Predictions only

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNA3P52797 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
EFNA3P52797 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
EFNA3P52797 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
EFNA3P52797 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
EFNA3P52797 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
EFNA3P52797 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
EFNA3P52797 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
EFNA3P52797 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
EFNA3P52797 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
EFNA3P52797 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
EFNA3P52797 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
EFNA3P52797 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
EFNA3P52797 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
EFNA3P52797 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
EFNA3P52797 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
EFNA3P52797 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
EFNA3P52797 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
EFNA3P52797 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
EFNA3P52797 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
EFNA3P52797 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
EFNA3P52797 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
EFNA3P52797 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
EFNA3P52797 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
EFNA3P52797 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
EFNA3P52797 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
EFNA3P52797 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
EFNA3P52797 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
EFNA3P52797 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
EFNA3P52797 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
EFNA3P52797 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
EFNA3P52797 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
EFNA3P52797 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
EFNA3P52797 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
EFNA3P52797 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
EFNA3P52797 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
EFNA3P52797 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
EFNA3P52797 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
EFNA3P52797 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
EFNA3P52797 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
EFNA3P52797 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
EFNA3P52797 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
EFNA3P52797 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
EFNA3P52797 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
EFNA3P52797 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
EFNA3P52797 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
EFNA3P52797 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
EFNA3P52797 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
EFNA3P52797 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
EFNA3P52797 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
EFNA3P52797 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
EFNA3P52797 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
EFNA3P52797 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
EFNA3P52797 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
EFNA3P52797 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
EFNA3P52797 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
EFNA3P52797 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
EFNA3P52797 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
EFNA3P52797 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
EFNA3P52797 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
EFNA3P52797 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
EFNA3P52797 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
EFNA3P52797 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
EFNA3P52797 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
EFNA3P52797 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
EFNA3P52797 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
EFNA3P52797 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
EFNA3P52797 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
EFNA3P52797 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
EFNA3P52797 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
EFNA3P52797 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
EFNA3P52797 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
EFNA3P52797 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
EFNA3P52797 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
EFNA3P52797 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
EFNA3P52797 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
EFNA3P52797 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
EFNA3P52797 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
EFNA3P52797 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
EFNA3P52797 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
EFNA3P52797 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
EFNA3P52797 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
EFNA3P52797 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
EFNA3P52797 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
EFNA3P52797 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
EFNA3P52797 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
EFNA3P52797 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
EFNA3P52797 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
EFNA3P52797 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
EFNA3P52797 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.32
EFNA3P52797 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
EFNA3P52797 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
EFNA3P52797 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
EFNA3P52797 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
EFNA3P52797 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
EFNA3P52797 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
EFNA3P52797 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
EFNA3P52797 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
EFNA3P52797 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
EFNA3P52797 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
EFNA3P52797 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.2 ms