Protein–RNA interactions for Protein: P49760

CLK2, Dual specificity protein kinase CLK2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 499 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLK2P49760 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
CLK2P49760 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
CLK2P49760 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
CLK2P49760 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
CLK2P49760 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
CLK2P49760 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CLK2P49760 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CLK2P49760 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CLK2P49760 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CLK2P49760 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CLK2P49760 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CLK2P49760 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CLK2P49760 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CLK2P49760 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CLK2P49760 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CLK2P49760 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CLK2P49760 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CLK2P49760 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CLK2P49760 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CLK2P49760 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CLK2P49760 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CLK2P49760 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CLK2P49760 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CLK2P49760 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CLK2P49760 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
CLK2P49760 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CLK2P49760 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
CLK2P49760 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CLK2P49760 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CLK2P49760 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CLK2P49760 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CLK2P49760 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CLK2P49760 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CLK2P49760 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CLK2P49760 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CLK2P49760 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CLK2P49760 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CLK2P49760 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CLK2P49760 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
CLK2P49760 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CLK2P49760 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CLK2P49760 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CLK2P49760 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CLK2P49760 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CLK2P49760 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
CLK2P49760 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CLK2P49760 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.16
CLK2P49760 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CLK2P49760 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CLK2P49760 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CLK2P49760 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CLK2P49760 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
CLK2P49760 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CLK2P49760 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CLK2P49760 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CLK2P49760 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CLK2P49760 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CLK2P49760 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
CLK2P49760 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CLK2P49760 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CLK2P49760 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CLK2P49760 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CLK2P49760 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CLK2P49760 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CLK2P49760 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
CLK2P49760 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
CLK2P49760 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
CLK2P49760 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
CLK2P49760 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CLK2P49760 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CLK2P49760 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
CLK2P49760 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CLK2P49760 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CLK2P49760 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
CLK2P49760 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CLK2P49760 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
CLK2P49760 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CLK2P49760 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CLK2P49760 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CLK2P49760 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CLK2P49760 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
CLK2P49760 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CLK2P49760 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CLK2P49760 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CLK2P49760 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CLK2P49760 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CLK2P49760 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CLK2P49760 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CLK2P49760 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CLK2P49760 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CLK2P49760 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
CLK2P49760 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CLK2P49760 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CLK2P49760 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CLK2P49760 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CLK2P49760 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CLK2P49760 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CLK2P49760 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
CLK2P49760 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CLK2P49760 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.1 ms