Protein–RNA interactions for Protein: P48788

TNNI2, Troponin I, fast skeletal muscle, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNI2P48788 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
TNNI2P48788 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
TNNI2P48788 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
TNNI2P48788 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
TNNI2P48788 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
TNNI2P48788 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
TNNI2P48788 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
TNNI2P48788 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
TNNI2P48788 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
TNNI2P48788 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
TNNI2P48788 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
TNNI2P48788 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
TNNI2P48788 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
TNNI2P48788 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC29.89■■■□□ 2.38
TNNI2P48788 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
TNNI2P48788 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC29.89■■■□□ 2.38
TNNI2P48788 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
TNNI2P48788 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
TNNI2P48788 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC29.88■■■□□ 2.37
TNNI2P48788 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
TNNI2P48788 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC29.88■■■□□ 2.37
TNNI2P48788 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
TNNI2P48788 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
TNNI2P48788 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
TNNI2P48788 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
TNNI2P48788 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
TNNI2P48788 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
TNNI2P48788 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
TNNI2P48788 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
TNNI2P48788 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
TNNI2P48788 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
TNNI2P48788 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
TNNI2P48788 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
TNNI2P48788 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
TNNI2P48788 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
TNNI2P48788 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
TNNI2P48788 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
TNNI2P48788 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
TNNI2P48788 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
TNNI2P48788 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
TNNI2P48788 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
TNNI2P48788 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
TNNI2P48788 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
TNNI2P48788 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
TNNI2P48788 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
TNNI2P48788 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
TNNI2P48788 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
TNNI2P48788 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
TNNI2P48788 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC29.82■■■□□ 2.36
TNNI2P48788 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
TNNI2P48788 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC29.82■■■□□ 2.36
TNNI2P48788 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC29.82■■■□□ 2.36
TNNI2P48788 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
TNNI2P48788 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
TNNI2P48788 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
TNNI2P48788 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
TNNI2P48788 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
TNNI2P48788 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
TNNI2P48788 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
TNNI2P48788 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
TNNI2P48788 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
TNNI2P48788 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
TNNI2P48788 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
TNNI2P48788 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
TNNI2P48788 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
TNNI2P48788 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
TNNI2P48788 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
TNNI2P48788 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
TNNI2P48788 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
TNNI2P48788 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
TNNI2P48788 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
TNNI2P48788 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC29.75■■■□□ 2.35
TNNI2P48788 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC29.75■■■□□ 2.35
TNNI2P48788 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
TNNI2P48788 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
TNNI2P48788 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
TNNI2P48788 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
TNNI2P48788 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
TNNI2P48788 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
TNNI2P48788 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
TNNI2P48788 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
TNNI2P48788 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC29.72■■■□□ 2.35
TNNI2P48788 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC29.72■■■□□ 2.35
TNNI2P48788 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
TNNI2P48788 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
TNNI2P48788 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
TNNI2P48788 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC29.71■■■□□ 2.35
TNNI2P48788 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC29.71■■■□□ 2.35
TNNI2P48788 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
TNNI2P48788 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
TNNI2P48788 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
TNNI2P48788 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
TNNI2P48788 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC29.7■■■□□ 2.35
TNNI2P48788 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC29.7■■■□□ 2.35
TNNI2P48788 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
TNNI2P48788 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
TNNI2P48788 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
TNNI2P48788 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
TNNI2P48788 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
TNNI2P48788 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms